RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	SCRN2	Q96FV2	425 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MRGPRX3	Q96LB0	322 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC115	Q96NT0	180 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ALG9	Q9H6U8	611 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NUP50	Q9UKX7	468 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MED16	Q9Y2X0	877 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	COMMD10	Q9Y6G5	202 aa		14.85	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NEMP2	A6NFY4	417 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RGS10	O43665	173 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DFNA5	O60443	496 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VPS26A	O75436	327 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NNMT	P40261	264 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	DGKG	P49619	791 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CSNK2B	P67870	215 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SMU1	Q2TAY7	513 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	USP45	Q70EL2	814 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IFNE	Q86WN2	208 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MYLIP	Q8WY64	445 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC38A4	Q969I6	547 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ASB16	Q96NS5	453 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GPR21	Q99679	349 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GDF15	Q99988	308 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NUAK2	Q9H093	628 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ADPRHL2	Q9NX46	363 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FAM50B	Q9Y247	325 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BCKDK	O14874	412 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PRAMEF1	O95521	474 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ESR1	P03372	595 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	NCK1	P16333	377 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BPI	P17213	487 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CTRB1	P17538	263 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ALOX12	P18054	663 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ITGAL	P20701	1170 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	AGXT	P21549	392 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCNA5	P22460	613 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	OR3A3	P47888	321 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KCNC1	P48547	511 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PTPN5	P54829	565 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	KEAP1	Q14145	624 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	RAB30	Q15771	203 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PYCR3	Q53H96	274 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SNX20	Q7Z614	316 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SORCS1	Q8WY21	1168 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	SMARCD2	Q92925	531 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	PTER	Q96BW5	349 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	P2RY12	Q9H244	342 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ASB8	Q9H765	288 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	IL26	Q9NPH9	171 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		14.84	□□□□□ -0.03
BBS1-225	ENST00000630659	EPOP	A6NHQ4	379 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659		A8MX80	341 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	MSL3P1	P0C860	447 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	CD36	P16671	472 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SPAM1	P38567	509 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	GPR50	Q13585	617 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		14.83	□□□□□ -0.04
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		14.83	□□□□□ -0.04

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