RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.08■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 PRSS56P0CW18 603 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNC3Q14003 757 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 EIPR1Q53HC9 387 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ABCB9Q9NP78 766 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 H0YC42 278 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 VIPR2P41587 438 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP4BP51164 291 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 COQ7Q99807 217 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PP55 124 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FDXRP22570 491 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 IL12BP29460 328 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 OMPP47874 163 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT74Q7RTS7 529 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TFECO14948 347 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ADH1BP00325 375 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CTSAP10619 480 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ALPPL2P10696 532 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF763Q0D2J5 394 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NANOGP8Q6NSW7 305 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NANOGQ9H9S0 305 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CLEC4AQ9UMR7 237 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 OARD1Q9Y530 152 aa20.07■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 BMPR1AP36894 532 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 GALK1P51570 392 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NTHL1P78549 312 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 OGFOD2Q6N063 350 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FAR1Q8WVX9 515 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 RELTQ969Z4 430 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 IFT27Q9BW83 186 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TAF1P21675 1872 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 C6orf47O95873 294 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 MXD1Q05195 221 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM189A1O60320 539 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 NPPAP01160 153 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 GRK6P43250 576 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPEARQ8WU66 669 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SMARCD2Q92925 531 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 PYURFQ96I23 114 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 IL4I1Q96RQ9 567 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 MTMR10Q9NXD2 777 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SEPHS1P49903 392 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TSPAN33Q86UF1 283 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TCEAL8Q8IYN2 117 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FIBINQ8TAL6 211 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC2A11Q9BYW1 496 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TRIM8Q9BZR9 551 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 XKR8Q9H6D3 395 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 BTAF1O14981 1849 aa20.06■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CCT3P49368 545 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CDH15P55291 814 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 KRT77Q7Z794 578 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 OR52B6Q8NGF0 335 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 REM1O75628 298 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 KAT7O95251 611 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 C9P02748 559 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 BPIP17213 487 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 MADCAM1Q13477 382 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4D1Q15615 310 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC30A6Q6NXT4 461 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 RAB7BQ96AH8 199 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNC2Q96PR1 638 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 C17orf62Q9BQA9 187 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ACSL5Q9ULC5 683 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ITGB4P16144 1822 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 GIMD1P0DJR0 217 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 GNSP15586 552 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 XKR4Q5GH76 650 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ISCA2Q86U28 154 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.05■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM92AA1XBS5 289 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 BNC1Q01954 994 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF789Q5FWF6 425 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.04■□□□□ 0.8
PTPRJ-208ENST00000615445 UTS2BQ765I0 119 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms