RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614197.4

NPIPB4-222, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB4, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDKL2	Q92772	493 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CNDP1	Q96KN2	507 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	C10orf90	Q96M02	699 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR2A5	Q96R48	311 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ATG10	Q9H0Y0	220 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDE10A	Q9Y233	779 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MED16	Q9Y2X0	877 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	VWA7	Q9Y334	891 aa		10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	IDS	B3KWA1	339 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197		H0YIG0	161 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	HAT1	O14929	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TTI1	O43156	1089 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	NRP2	O60462	931 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	AHSG	P02765	367 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CCR8	P51685	355 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDKN2D	P55273	166 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MGAT5	Q09328	741 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	HKDC1	Q2TB90	917 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	RBM20	Q5T481	1227 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	DUPD1	Q68J44	220 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	LCTL	Q6UWM7	567 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ASPG	Q86U10	573 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PLD3	Q8IV08	490 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		10.42	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	USP27X	A6NNY8	438 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ALOX12B	O75342	701 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	GUCA1C	O95843	209 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPINA7	P05543	415 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SERPIND1	P05546	499 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CYC1	P08574	325 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC26A3	P40879	764 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ARG2	P78540	354 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	RGS1	Q08116	209 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CDC16	Q13042	620 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CSHL1	Q14406	222 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TLR1	Q15399	786 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197		Q6ZS92	163 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	CREG2	Q8IUH2	290 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	LMF1	Q96S06	567 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	KRT12	Q99456	494 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	EGFL8	Q99944	293 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	TEX264	Q9Y6I9	313 aa		10.41	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	FAM187A	A6NFU0	413 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	URAD	A6NGE7	173 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MASP2	O00187	686 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	FFAR3	O14843	346 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	GPR42	O15529	346 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	OR1F1	O43749	312 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	MED26	O95402	600 aa		10.4	□□□□□ -0.74
NPIPB4-222	ENST00000614197	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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