RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 RAD51DO75771 328 aa18.14■□□□□ 0.49
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PTPRJ-207ENST00000613246 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 COL28A1Q2UY09 1125 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PM20D2Q8IYS1 436 aa18.14■□□□□ 0.49
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PTPRJ-207ENST00000613246 ITPAQ9BY32 194 aa18.14■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 BCAS3Q9H6U6 928 aa18.14■□□□□ 0.49
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PTPRJ-207ENST00000613246 COL21A1Q96P44 957 aa18.13■□□□□ 0.49
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PTPRJ-207ENST00000613246 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.12■□□□□ 0.49
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PTPRJ-207ENST00000613246 DCST2Q5T1A1 773 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 C12orf40Q86WS4 652 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 WDSUB1Q8N9V3 476 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 INSIG1O15503 277 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRJ-207ENST00000613246 NFATC1O95644 943 aa18.12■□□□□ 0.49
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