RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZNHIT1O43257 154 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KDM1AO60341 852 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CDH16O75309 829 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KRT36O76013 467 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PGLSO95336 258 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ABHD2P08910 425 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 STIP1P31948 543 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 RELAQ04206 551 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 RUNX1T1Q06455 604 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KLHL30Q0D2K2 578 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SPARCL1Q14515 664 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 C1orf189Q5VU69 101 aa11.16□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 C11orf96Q7Z7L8 435 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 OOSP2Q86WS3 158 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PDSS2Q86YH6 399 aa11.16□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.16□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 EID3Q8N140 333 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.16□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 MCUR1Q96AQ8 359 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TSG101Q99816 390 aa11.16□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 MENTQ9BUN1 341 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 Q9H521 79 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 NEUROD4Q9HD90 331 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KCNJ16Q9NPI9 418 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ASB1Q9Y576 335 aa11.16□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 A0A088AWK7 358 aa11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 EPHB6O15197 1021 aa11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 DENRO43583 198 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 TGDSO95455 350 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PRAMEF1O95521 474 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TSPAN12O95859 305 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 F10P00742 488 aa11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 CTNNA2P26232 953 aa11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 TBCCQ15814 346 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 H2AFVQ71UI9 128 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 KBTBD2Q8IY47 623 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 OR6Y1Q8NGX8 325 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 GDAP1Q8TB36 358 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 FBXO25Q8TCJ0 367 aa11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 CCT7Q99832 543 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 HGH1Q9BTY7 390 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 OR2AG1Q9H205 316 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 ZNF696Q9H7X3 374 aa11.15□□□□□ -0.62
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HCG18-241ENST00000602290 UVRAGQ9P2Y5 699 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SERTAD3Q9UJW9 196 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HCG18-241ENST00000602290 A0A087X0T9 212 aa11.14□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 IDSB3KWA1 339 aa11.14□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 BUD23O43709 281 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 FZD6O60353 706 aa11.14□□□□□ -0.63
HCG18-241ENST00000602290 HAUS5O94927 633 aa11.14□□□□□ -0.63
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