RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 STMN3Q9NZ72 180 aa24.28■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 CATP04040 527 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGER4P35408 488 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 AP2B1P63010 937 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 RPTNQ6XPR3 784 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 LANCL3Q6ZV70 420 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 GDF7Q7Z4P5 450 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 ADCK2Q7Z695 626 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 TXLNBQ8N3L3 684 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A3Q99726 388 aa24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CAPNS1-211ENST00000590874 E7ENX8 843 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SMAPO00193 183 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TXNDC9O14530 226 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 HSD17B2P37059 387 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TAP2Q03519 686 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RELAQ04206 551 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM53BQ14153 422 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MTFR2Q6P444 385 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 REXO1L1PQ8IX06 675 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OR9A4Q8NGU2 314 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TCF12Q99081 682 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST11Q9NPF2 352 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SOX13Q9UN79 622 aa24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 A8MUI8 341 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 AP3B1O00203 1094 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC19A2O60779 497 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 F7P08709 466 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OGNP20774 298 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CLCN7P51798 805 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ADORA2A-AS1P86434 159 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RBPJQ06330 500 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CCNG2Q16589 344 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF766Q5HY98 468 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FCRLBQ6BAA4 426 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CENPUQ71F23 418 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS41Q7RTY9 318 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 GIMAP7Q8NHV1 300 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 METTL21AQ8WXB1 218 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 LURAP1Q96LR2 239 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TEKT2Q9UIF3 430 aa24.25■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PDZD2O15018 2839 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF839A8K0R7 811 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 E5RI56 91 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PFDN6O15212 129 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MYBL2P10244 700 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 COX6B1P14854 86 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 AVPR1BP47901 424 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ABATP80404 500 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 C3AR1Q16581 482 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NDUFA9Q16795 377 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 LONRF1Q17RB8 773 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 BTBD16Q32M84 506 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CILP2Q8IUL8 1156 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 BEST3Q8N1M1 668 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CYTH2Q99418 400 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM8Q9BZR9 551 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TINAGQ9UJW2 476 aa24.24■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2W5A6NFC9 320 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 H7BY64 318 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SYF2O95926 243 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CUL1Q13616 776 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MINDY4Q4G0A6 757 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PLAG1Q6DJT9 500 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 VN1R4Q7Z5H5 301 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAP1Q96NZ9 151 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 RBSNQ9H1K0 784 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MYO7BQ6PIF6 2116 aa24.23■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 H0YIG0 161 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ST13P50502 369 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 ACER2Q5QJU3 275 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 H3F3CQ6NXT2 135 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 C4orf22Q6V702 233 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MACROD1Q9BQ69 325 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 HES7Q9BYE0 225 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 HCN3Q9P1Z3 774 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 MED16Q9Y2X0 877 aa24.22■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 AVILO75366 819 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 NSA2O95478 260 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TPSB2P20231 275 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 KCNJ1P48048 391 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CASP6P55212 293 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TUBA3CQ13748 450 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 CDSNQ15517 529 aa24.21■■□□□ 1.47
CAPNS1-211ENST00000590874 TPSAB1Q15661 275 aa24.21■■□□□ 1.47
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