RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 AP1S1P61966 158 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RELQ04864 619 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF33BQ06732 778 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 NIPAL4Q0D2K0 466 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SCRN3Q0VDG4 424 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CUL1Q13616 776 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM14Q14142 442 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 GALNT3Q14435 633 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SQLEQ14534 574 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MESDQ14696 234 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 POU4F3Q15319 338 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TSC22D1Q15714 1073 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RPE65Q16518 533 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MEA1Q16626 185 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MAPKAPK3Q16644 382 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 NFIL3Q16649 462 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 DPCR1Q3MIW9 517 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 PARP15Q460N3 678 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 EMC4Q5J8M3 183 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RNFT1Q5M7Z0 435 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF569Q5MCW4 686 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 GPRC6AQ5T6X5 926 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MANEALQ5VSG8 457 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 METTL11BQ5VVY1 283 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TCERG1LQ5VWI1 586 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RESP18Q5W5W9 173 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ALS2CLQ60I27 953 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC66Q68CR7 880 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SPINK14Q6IE38 97 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SLC25A25Q6KCM7 469 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TTI2Q6NXR4 508 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TLDC1Q6P9B6 456 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CRTC3Q6UUV7 619 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 KDELC1Q6UW63 502 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 USP51Q70EK9 711 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RRAGAQ7L523 313 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 JAZF1Q86VZ6 243 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CNGA4Q8IV77 575 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 PPM1KQ8N3J5 372 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ANKRD53Q8N9V6 530 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 OR4E2Q8NGC2 313 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 OR5M3Q8NGP4 307 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SLC22A8Q8TCC7 542 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 P3H4Q92791 437 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 KAT5Q92993 513 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM63Q969Q1 353 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 NCLNQ969V3 563 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SGK3Q96BR1 496 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 C8orf44Q96CB5 159 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ITPKCQ96DU7 683 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 GIMAP5Q96F15 307 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC46Q96FV0 321 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MED30Q96HR3 178 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CFAP57Q96MR6 1250 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SMIM14Q96QK8 99 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 WDR24Q96S15 920 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MNTQ99583 582 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SPSB2Q99619 263 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 MESP1Q9BRJ9 268 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SIKE1Q9BRV8 207 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TIMM29Q9BSF4 260 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 YIPF4Q9BSR8 244 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 HES7Q9BYE0 225 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 FAM192AQ9GZU8 254 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 HSD3B7Q9H2F3 369 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 FAM83DQ9H4H8 585 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 WDR54Q9H977 334 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ARNT2Q9HBZ2 717 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 FAM60AQ9NP50 221 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 PFDN4Q9NQP4 134 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 TBCCD1Q9NVR7 557 aa2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SNORD53-201ENST00000579969 ZFATQ9P243 1243 aa2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms