RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPINB1P30740 379 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 S100A3P33764 101 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTR1BP42025 376 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASMTP46597 345 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 C21orf58P58505 322 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ACTR1AP61163 376 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ICE2Q659A1 982 aa28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM74Q96NL1 305 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52E6Q96RD3 313 aa28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXQ1Q9C009 403 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 NANOGQ9H9S0 305 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLAMF8Q9P0V8 285 aa28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BNIP2Q12982 314 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZFP1Q6P2D0 407 aa28.01■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ICKQ9UPZ9 632 aa28.01■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANP32DO95626 131 aa28■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 REEP5Q00765 189 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SIX5Q8N196 739 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 CGREF1Q99674 301 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPSD1Q9BZJ3 242 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 XKR8Q9H6D3 395 aa28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 PSMB5P28074 263 aa27.99■■■□□ 2.07
CTDNEP1-208ENST00000573600 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.072e-7■■■■□ 21.6
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CTDNEP1-208ENST00000573600 A6NCN8 305 aa27.96■■■□□ 2.07
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFS2O75306 463 aa27.96■■■□□ 2.07
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