RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 MTX2O75431 263 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 VPS26AO75436 327 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRIM16O95361 564 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 AMY1AP04745 511 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 GSTA1P08263 222 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CCDC166P0CW27 439 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF30P17039 623 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHRM3P20309 590 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TAC1P20366 129 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 DRD1P21728 446 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSMA3P25788 255 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ALDH3A1P30838 453 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 P2RY2P41231 377 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PTGER3P43115 390 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 POLD2P49005 469 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC18A1P54219 525 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 SCAND1P57086 179 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPS14P62263 151 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 SATB1Q01826 763 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ELP6Q0PNE2 266 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TDGQ13569 410 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHI3L2Q15782 390 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CST6Q15828 149 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PDK4Q16654 411 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF284Q2VY69 593 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 LEXMQ3ZCV2 418 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM46CQ5VWP2 391 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 NAPRTQ6XQN6 538 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 GALNT7Q86SF2 657 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUDCD3Q8IVD9 361 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RBFAQ8N0V3 343 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 HDDC3Q8N4P3 179 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 AADATQ8N5Z0 425 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 FITM2Q8N6M3 262 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 BCAS4Q8TDM0 211 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 HCAR2Q8TDS4 363 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 HEXDCQ8WVB3 486 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM3CQ92520 227 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLK6Q92876 244 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 AP2M1Q96CW1 435 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 NUS1Q96E22 293 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHMP6Q96FZ7 201 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 GPR21Q99679 349 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM83DQ9H4H8 585 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 ASB6Q9NWX5 421 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 GALPQ9UBC7 116 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 XPR1Q9UBH6 696 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 SERGEFQ9UGK8 458 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNPTGQ9UJJ9 305 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRSS21Q9Y6M0 314 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYO10Q9HD67 2058 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPC1O15118 1278 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 KLHL2O95198 593 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 DNTTP04053 509 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PCCBP05166 539 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PYGLP06737 847 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 BPGMP07738 259 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 DHRS4L1P0CG22 281 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 MYL2P10916 166 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 CPA3P15088 417 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 GM2AP17900 193 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 TFEBP19484 476 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 MSH3P20585 1137 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 DRD4P21917 467 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-202ENST00000559357 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.7 ms