RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM129CQ86XR2 697 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LAS2Q8IYD9 372 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MINDY1Q8N5J2 469 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KYQ8NBH2 561 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MRGBPQ9NV56 204 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HRASLS2Q9NWW9 162 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC100653049A0A140TA62 436 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FEZF1A0PJY2 475 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERTM1A2A2V5 107 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM221BA6H8Z2 402 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PPM1DO15297 605 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHGA12O60330 932 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRT34O76011 436 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GIMD1P0DJR0 217 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PIK3R1P27986 724 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GRK3P35626 688 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIO3P55073 304 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NME5P56597 212 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSTA3Q16772 222 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4C6Q8NH72 309 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC38A3Q99624 504 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 DPH7Q9BTV6 452 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 UCK1Q9HA47 277 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1orf109Q9NX04 203 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.56■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 C2orf74A8MZ97 194 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR1F1O43749 312 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP5HO75947 161 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF806P0C7X5 589 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 T-ENOLP0DO92 83 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IDO1P14902 403 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TYRP1P17643 537 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CSNK1G2P78368 415 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 EMX2Q04743 252 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL23RQ5VWK5 629 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARMC6Q6NXE6 501 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OOSP2Q86WS3 158 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MIER2Q8N344 545 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 POU5F2Q8N7G0 328 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNH6Q9H252 994 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 BRF2Q9HAW0 419 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC6A20Q9NP91 592 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM184CQ9NVA4 438 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL20Q9Y2M5 609 aa16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LNP1A1A4G5 178 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC22A2O15244 555 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNC5CO95185 931 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TGFB1P01137 390 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF883P0CG24 379 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSD3B1P14060 373 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 UGT2B7P16662 529 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMD1P17707 334 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CALB2P22676 271 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HSD3B2P26439 372 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPA2P48052 419 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP4BP51164 291 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 REEP5Q00765 189 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGKQ53H12 422 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLD3Q8IV08 490 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2A14Q96R47 310 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC167Q9P0B6 97 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HRH2P25021 359 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 DMTNQ08495 405 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAA25Q14CX7 972 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CACHD1Q5VU97 1274 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLHL35Q6PF15 583 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PAOXQ6QHF9 649 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRIM73Q86UV7 250 aa16.54■□□□□ 0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms