RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2E3Q969T4 207 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXL8Q96CD0 374 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAR2Q96K12 515 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 IL17FQ96PD4 163 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GBP5Q96PP8 586 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CYTH2Q99418 400 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AIF1LQ9BQI0 150 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC77Q9BR77 488 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TRIM51Q9BSJ1 452 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC29A3Q9BZD2 475 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DPH5Q9H2P9 285 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 EPS8L2Q9H6S3 715 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLAMF7Q9NQ25 335 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR83Q9NYM4 423 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MOCS1Q9NZB8 636 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ABI3Q9P2A4 366 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PYCARDQ9ULZ3 195 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 NAV3Q8IVL0 2385 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DYTNA2CJ06 578 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ARGFXA6NJG6 315 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL8A6PVC2 850 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 H0YGG7 62 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 H0YIG0 161 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 H7BY64 318 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK2AP1O14519 115 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CLGNO14967 610 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RAD51CO43502 376 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 VPS4BO75351 444 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TIAF1O95411 115 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ONECUT2O95948 504 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ACPPP15309 386 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ITGA3P26006 1051 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTFP26441 200 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 IMPA1P29218 277 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SERPINB1P30740 379 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AHRP35869 848 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MAGEA4P43358 317 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AGTR2P50052 363 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TBPL1P62380 186 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PHEXP78562 749 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 NAE1Q13564 534 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 LAPTM5Q13571 262 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GRB7Q14451 532 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZIC1Q15915 447 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PHKG1Q16816 387 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PAGE2BQ5JRK9 111 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FCRL6Q6DN72 434 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF549Q6P9A3 640 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AGTRAPQ6RW13 159 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM198BQ6UWH4 519 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SUSD1Q6UWL2 747 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CYHR1Q6ZMK1 362 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PAQR7Q86WK9 346 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 HOMEZQ8IX15 550 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 GALNT16Q8N428 558 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 EXD3Q8N9H8 876 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC38A9Q8NBW4 561 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 STAG3L4Q8TBR4 150 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC13A3Q8WWT9 602 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PPM1MQ96MI6 270 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF285Q96NJ3 590 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PRAP1Q96NZ9 151 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 AGAP4Q96P64 663 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 NDNQ99608 321 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 CRB3Q9BUF7 120 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 MENTQ9BUN1 341 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 TGIF2Q9GZN2 237 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 ROGDIQ9GZN7 287 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 DERL2Q9GZP9 239 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 PELI2Q9HAT8 420 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 NMRAL1Q9HBL8 299 aa5.35□□□□□ -1.55
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM60AQ9NP50 221 aa5.35□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms