RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXO42Q6P3S6 717 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MDGA2Q7Z553 956 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX20Q7Z614 316 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEKT5Q96M29 485 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPATA13Q96N96 652 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYT11Q9BT88 431 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRC3Q9H069 523 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SYNPO2LQ9H987 977 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 B4GALT7Q9UBV7 327 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IP6K2Q9UHH9 426 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANAPC7Q9UJX3 599 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa9.54□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0U1RQJ8 604 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PINLYPA6NC86 204 aa9.53□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 BCKDKO14874 412 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TPM2P07951 284 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC172P0C7W6 258 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACRV1P26436 265 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MC4RP32245 332 aa9.53□□□□□ -0.88
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDK2Q15119 407 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT31Q15323 416 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC38Q502W7 563 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF44Q7L0R7 432 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAP7D3Q8IWC1 876 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLD5Q8N7P1 536 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR9A4Q8NGU2 314 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PIGTQ969N2 578 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MVB12AQ96EY5 273 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LPAR4Q99677 370 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL19Q99731 98 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOL2Q9BQE5 337 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C19orf24Q9BVV8 132 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FSD1LQ9BXM9 530 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBCK1Q9BYM8 510 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YAE1D1Q9NRH1 226 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCN3Q9P1Z3 774 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.53□□□□□ -0.88
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC5A10A0PJK1 596 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARHGEF33A8MVX0 844 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 G3V3Y1 287 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DVL2O14641 736 aa9.52□□□□□ -0.89
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 XCR1P46094 333 aa9.52□□□□□ -0.89
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC26A5P58743 744 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYNLT1P63172 113 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRB7Q14451 532 aa9.52□□□□□ -0.89
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NSDHLQ15738 373 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TYSND1Q2T9J0 566 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIPK1Q86Z02 1210 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VRK3Q8IV63 474 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NIPA2Q8N8Q9 360 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NAXEQ8NCW5 288 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2L3Q8NG85 312 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51Q1Q8NH59 317 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAF2Q96CS3 445 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CAPZA3Q96KX2 299 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF157Q96PX1 679 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DPH7Q9BTV6 452 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FICDQ9BVA6 458 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBTD1Q9HAC8 227 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEPPQ9NTK1 212 aa9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087X1B8 175 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 QSOX1O00391 747 aa9.51□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
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