RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 JUPP14923 745 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 BCL6P41182 706 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PHF19Q5T6S3 580 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GRHL2Q6ISB3 625 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD53Q8N9V6 530 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NETO1Q8TDF5 533 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RNF31Q96EP0 1072 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CCDC74BQ96LY2 380 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PELI2Q9HAT8 420 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SOHLH2Q9NX45 425 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SNX7Q9UNH6 387 aa21.8■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 OR2A25A4D2G3 310 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RFPL3O75679 317 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CASP2P42575 452 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 RPL14P50914 215 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SQSTM1Q13501 440 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TBCCQ15814 346 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LIPJQ5W064 366 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR34Q96EX3 536 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CEP250Q9BV73 2442 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PDX1P52945 283 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 REEP5Q00765 189 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PCDH1Q08174 1060 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 FRMPD2BQ6IN97 320 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.083e-9■■■■■ 348.1
TSNARE1-208ENST00000524325 OR7G3Q8NG95 312 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4D9Q8NGE8 314 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 GRAMD1AQ96CP6 724 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 C7orf26Q96N11 449 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 AIF1LQ9BQI0 150 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EHD1Q9H4M9 534 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TRPS1Q9UHF7 1281 aa21.79■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 HMOX2P30519 316 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NAA20P61599 178 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ABRAXAS2Q15018 415 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 KANK2Q63ZY3 851 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 OR4N4Q8N0Y3 316 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZUFSPQ96AP4 578 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 EFCAB11Q9BUY7 163 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 TUBB1Q9H4B7 451 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MANBAO00462 879 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SERPIND1P05546 499 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 THRAP10827 490 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 E2F2Q14209 437 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CGB2Q6NT52 195 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MED27Q6P2C8 311 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 SLITRK4Q8IW52 837 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CLYBLQ8N0X4 340 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CD180Q99467 661 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PILRAQ9UKJ1 303 aa21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 UGDHO60701 494 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 PDYNP01213 254 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00032P0C843 101 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 UROSP10746 265 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 HNF4AP41235 474 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 MAVSQ7Z434 540 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 HUS1BQ8NHY5 278 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 NUF2Q9BZD4 464 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOVL6Q9H5J4 265 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 STARD5Q9NSY2 213 aa21.77■■□□□ 1.08
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FGF4P08620 206 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 GGTA1PQ4G0N0 100 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 PAGE2BQ5JRK9 111 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FRG2Q64ET8 278 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 KRT78Q8N1N4 520 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 TWIST2Q8WVJ9 160 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CCT6BQ92526 530 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FRG2BQ96QU4 278 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 NPHS2Q9NP85 383 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 HAO1Q9UJM8 370 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 STK38LQ9Y2H1 464 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 PIP5K1BO14986 540 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 ENO1P06733 434 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.76■■□□□ 1.07
TSNARE1-208ENST00000524325 FOLR1P15328 257 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms