RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 RIT1Q92963 219 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MR1Q95460 341 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGED4Q96JG8 741 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT12Q99456 494 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 EGLN3Q9H6Z9 239 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERAP1Q9NZ08 941 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAJB9Q9UBS3 223 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CACNG5Q9UF02 275 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 EPHA6Q9UF33 1036 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 RASAL2Q9UJF2 1139 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDR37Q9Y2I8 494 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLK4Q9Y5K2 254 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MTMR11A4FU01 709 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 F8VVB4 439 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 F8VWA3 439 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 NPIPA3F8WFD2 350 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PI4K2BG5E9Z4 385 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 FPGTO14772 594 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPIP5K2O43314 1243 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SELENOFO60613 162 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPN1P04843 607 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATP1B1P05026 303 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD34CP0C6C1 535 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRT3P12035 628 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 LBPP18428 481 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CYP2A7P20853 494 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SFTPDP35247 375 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CETN2P41208 172 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SOX3P41225 446 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRKCIP41743 596 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR3A2P47893 321 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PAX9P55771 341 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR1D5P58170 312 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCN1BQ07699 218 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SGCGQ13326 291 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRIM29Q14134 588 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZFP69Q49AA0 526 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 C11orf88Q6PI97 169 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q6ZRP5 223 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 Q6ZSR9 355 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 C4orf19Q8IY42 314 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS35Q8N3Z0 413 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 AMER3Q8N944 861 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 NCOA7Q8NI08 942 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC26A7Q8TE54 656 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNASE1L2Q92874 299 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PYCR2Q96C36 320 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SGF29Q96ES7 293 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 POM121L2Q96KW2 1035 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 BTBD9Q96Q07 612 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PI4K2AQ9BTU6 479 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDK19Q9BWU1 502 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBQLN3Q9H347 655 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 C10orf88Q9H8K7 445 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZWILCHQ9H900 591 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL36AQ9UHA7 158 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASIC3Q9UHC3 531 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXL4Q9UKA2 621 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDH7Q9ULB5 785 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 POMT1Q9Y6A1 747 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 SNED1Q8TER0 1413 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAV18A0A075B6X5 111 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0B4J203 849 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A1W2PR80 420 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 OOEPA6NGQ2 149 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRSS46E5RG02 174 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF195O14628 629 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEACAM4O75871 244 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 YES1P07947 543 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 STAG3L1P0CL83 205 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TYMPP19971 482 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 HLA-FP30511 346 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 IL10RBQ08334 325 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 FCN2Q15485 313 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-377P-201ENST00000515965 TAB1Q15750 504 aa2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms