RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 UGT3A1Q6NUS8 523 aa23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 NDUFAF7Q7L592 441 aa23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 PLD3Q8IV08 490 aa23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35F6Q8N357 371 aa23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 SLC5A6Q9Y289 635 aa23.43■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 A0A1W2PQ72 361 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 FAM53BQ14153 422 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 CRYMQ14894 314 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 FAAH2Q6GMR7 532 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 C5orf34Q96MH7 638 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 LMF1Q96S06 567 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 NDNQ99608 321 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 TGIF2Q9GZN2 237 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 RIC8BQ9NVN3 520 aa23.42■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 H7BY64 318 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 KLHL18O94889 574 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 LDLRP01130 860 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 PRR35P0CG20 571 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 HRH2P25021 359 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 RGS4P49798 205 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 SYT16Q17RD7 645 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 GRHL3Q8TE85 626 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 PRAP1Q96NZ9 151 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM184CQ9NVA4 438 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 PTGFRNQ9P2B2 879 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 ASIC3Q9UHC3 531 aa23.41■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 SERPINA7P05543 415 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 C8GP07360 202 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 UQCRHP07919 91 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 AVPR1BP47901 424 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 ARG2P78540 354 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 SP140Q13342 867 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 MCOLN3Q8TDD5 553 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 PCBD2Q9H0N5 130 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa23.4■■□□□ 1.34
ALYREF-203ENST00000511412 DYTNA2CJ06 578 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 WIPF3A6NGB9 483 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 E2F3O00716 465 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CES2O00748 559 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TTC4O95801 387 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 STATHP02808 62 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SOX11P35716 441 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 FAM180AQ6UWF9 173 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PALM2Q8IXS6 379 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC138Q96M89 665 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MKL2Q9ULH7 1088 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SNX12Q9UMY4 172 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PDE10AQ9Y233 779 aa23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SPANXN3Q5MJ09 141 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 VN1R4Q7Z5H5 301 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SIRT6Q8N6T7 355 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 FAR1Q8WVX9 515 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PSMF1Q92530 271 aa23.38■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 H0YIG0 161 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 BMP10O95393 424 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 NSA2O95478 260 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 EDN3P14138 238 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 AP2B1P63010 937 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PCOLCEQ15113 449 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 AGTRAPQ6RW13 159 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM205Q6UW68 189 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PCGF5Q86SE9 256 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 C17orf64Q86WR6 236 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 OR9A4Q8NGU2 314 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 THAP11Q96EK4 314 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 NAT9Q9BTE0 207 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF700Q9H0M5 742 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 PARVBQ9HBI1 364 aa23.37■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 SLC16A5O15375 505 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 ZSCAN12O43309 604 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 BANF1O75531 89 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 WFS1O76024 890 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 CELA2AP08217 269 aa23.36■■□□□ 1.33
ALYREF-203ENST00000511412 C8orf89P0DMQ9 161 aa23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms