RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 SDC3O75056 442 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ATP9AO75110 1047 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 LRCH4O75427 683 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GPC4O75487 556 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 JRKO75564 520 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PRAMEF1O95521 474 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MT-ND1P03886 318 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CD1AP06126 327 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MMP10P09238 476 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RRASP10301 218 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 AKR1A1P14550 325 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ITGB5P18084 799 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SPINK2P20155 84 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MGAT1P26572 445 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OXTRP30559 389 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RAD23BP54727 409 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CTXN1P60606 82 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SPCS3P61009 180 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ARF6P62330 175 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 BNIP3Q12983 259 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 BFSP2Q13515 415 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SLC5A12Q1EHB4 618 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 KLHL22Q53GT1 634 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SEL1L2Q5TEA6 688 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 WSCD1Q658N2 575 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MSANTD2Q6P1R3 559 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SYT10Q6XYQ8 523 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 KBTBD2Q8IY47 623 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF786Q8N393 782 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GRHL3Q8TE85 626 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SNX33Q8WV41 574 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PHYHIPQ92561 330 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ARRDC3Q96B67 414 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 LMLNQ96KR4 655 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 LRRC37BQ96QE4 947 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 NDNQ99608 321 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OMDQ99983 421 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 H2AFJQ9BTM1 129 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 LACRTQ9GZZ8 138 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PDZD7Q9H5P4 517 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ABCB10Q9NRK6 738 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PEMTQ9UBM1 199 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RPH3ALQ9UNE2 315 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 USP22Q9UPT9 525 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 B8ZZF3 427 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 KDELR3O43731 214 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MPIG6BO95866 241 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DHFRP00374 187 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 F10P00742 488 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CYBBP04839 570 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ICAM1P05362 532 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 STSP08842 583 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CTXN2P0C2S0 81 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PAICSP22234 425 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SLC6A6P31641 620 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CD79BP40259 229 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SLC1A2P43004 574 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TGM4P49221 684 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 GNG10P50151 68 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF75DP51815 510 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 F2RL1P55085 397 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 UBE2G2P60604 165 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 VSNL1P62760 191 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CDK18Q07002 472 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGAP1Q07960 439 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TMED2Q15363 201 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PSG3Q16557 428 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ME3Q16798 604 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 USP41Q3LFD5 358 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 COQ5Q5HYK3 327 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MANEALQ5VSG8 457 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 IL23RQ5VWK5 629 aa6.99□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TTC23Q5W5X9 447 aa6.99□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms