RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480907.5

NUB1-208, Transcript of negative regulator of ubiquitin like proteins 1, human

TSL 5

Gene NUB1, Length 977 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUB1-208	ENST00000480907	CDH18	Q13634	790 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	TAB1	Q15750	504 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	NSMAF	Q92636	917 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	EGFL8	Q99944	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907		A0A087WV48	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PRAF2	O60831	178 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	IGHE	P01854	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	KRT5	P13647	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	UGT1A4	P22310	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PRKACG	P22612	351 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	MFAP3	P55082	362 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	HUNK	P57058	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	OR1D5	P58170	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CACNG1	Q06432	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	NFATC2	Q13469	925 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	WBP1	Q96G27	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CSNK1G3	Q9Y6M4	447 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907		E9PQ18	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SOCS3	O14543	225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	APOA4	P06727	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	DOK6	Q6PKX4	331 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	GPC2	Q8N158	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PGM2	Q96G03	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	GDAP1L1	Q96MZ0	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	AGAP3	Q96P47	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	MED20	Q9H944	212 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	IL16	Q14005	1332 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CEACAM4	O75871	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	MYL6B	P14649	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	ADRA2C	P18825	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	NAGLU	P54802	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	DCDC1	P59894	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	IRX4	P78413	519 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	TNK1	Q13470	666 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	UGCG	Q16739	394 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	C2CD6	Q53TS8	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	METTL7B	Q6UX53	244 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	RAD54L	Q92698	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SIPA1	Q96FS4	1042 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	MGME1	Q9BQP7	344 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NUB1-208	ENST00000480907		A0A1W2PPW3	197 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUB1-208	ENST00000480907	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NUB1-208	ENST00000480907	FAM86B1	E9PN63	330 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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