RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 RNF32Q9H0A6 362 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CHRAC1Q9NRG0 131 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF835Q9Y2P0 537 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.99□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 GRID2IPA4D2P6 1211 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 FAM227AF5H4B4 570 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 P2RX6O15547 441 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SUN1O94901 812 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CMPK1P30085 196 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 FMO4P31512 558 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CD96P40200 585 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CETN2P41208 172 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CRADDP78560 199 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF33BQ06732 778 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 TUBA3CQ13748 450 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SPA17Q15506 151 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF766Q5HY98 468 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CTSL3PQ5NE16 218 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ABHD17BQ5VST6 288 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SPINK14Q6IE38 97 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF425Q6IV72 752 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 TUBA3EQ6PEY2 450 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SPPL2CQ8IUH8 684 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 BEST3Q8N1M1 668 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 RNF214Q8ND24 703 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 OR9A1PQ8NGU1 263 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ATG4AQ8WYN0 398 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 FAM136AQ96C01 138 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CYTH2Q99418 400 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 KLHL1Q9NR64 748 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CATSPERZQ9NTU4 200 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD10Q9NXR5 420 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MEMO1Q9Y316 297 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PCM1Q15154 2024 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PNR3 127 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 NPIPA5E9PKD4 350 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 F8W8V4 182 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ADAM10O14672 748 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 DIAPH2O60879 1101 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 NIPSNAP2O75323 286 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MATN4O95460 622 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CLDN14O95500 239 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 UQCRHP07919 91 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ERVK-10P10266 1014 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ICAM2P13598 275 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 AGAP20933 346 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 NMBRP28336 390 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SSTR2P30874 369 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEP78395 509 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 HSF1Q00613 529 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 RBPJQ06330 500 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 GBX1Q14549 363 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 P3H1Q32P28 736 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ACSBG2Q5FVE4 666 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 ACER2Q5QJU3 275 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MTFR2Q6P444 385 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CES3Q6UWW8 571 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 TREML1Q86YW5 311 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC170Q8IYT3 715 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 PPFIBP2Q8ND30 876 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 MDS2Q8NDY4 140 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.97□□□□□ -1.13
CTPS1-208ENST00000479480 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms