RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474409.1

CNN3-205, Transcript of calponin 3, human

TSL 3

Gene CNN3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNN3-205	ENST00000474409	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TIMM22	Q9Y584	194 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	FRYL	O94915	3013 aa		8.01	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SEC16A	O15027	2179 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SDK2	Q58EX2	2172 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409		A0A0J9YVX5	310 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409		A0A1W2PQM1	296 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TRBC2	A0A5B9	178 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	GMNC	A6NCL1	334 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409		A8MU76	341 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	OR1F1	O43749	312 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	NRP2	O60462	931 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PRAMEF4	O60810	478 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CBFA2T3	O75081	653 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	WFS1	O76024	890 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	C9	P02748	559 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	THRA	P10827	490 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CD1C	P29017	333 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SERPINB3	P29508	390 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	GRIA3	P42263	894 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	LSS	P48449	732 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	HTR6	P50406	440 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SEC24C	P53992	1094 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CYP4F2	P78329	520 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CSNK1G2	P78368	415 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ILK	Q13418	452 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	IMPG1	Q17R60	797 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SGO1	Q5FBB7	561 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PHF19	Q5T6S3	580 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZNF425	Q6IV72	752 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	RNF44	Q7L0R7	432 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	FAM129C	Q86XR2	697 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PLD3	Q8IV08	490 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CARF	Q8N187	725 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TTL	Q8NG68	377 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	C19orf60	Q96EN9	201 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	NUF2	Q9BZD4	464 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	EPN3	Q9H201	632 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	FANCE	Q9HB96	536 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	HAO1	Q9UJM8	370 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZNF225	Q9UK10	706 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	BTRC	Q9Y297	605 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TRAF6	Q9Y4K3	522 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	8	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409		A0A0G2JND7	137 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	OR2A25	A4D2G3	310 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409		H0YIV9	168 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	MANBA	O00462	879 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	PIP5K1B	O14986	540 aa		7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	7.99	□□□□□ -1.13
CNN3-205	ENST00000474409	HDAC3	O15379	428 aa		7.99	□□□□□ -1.13

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