RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 CHRNGP07510 517 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 THRBP10828 461 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SRCP12931 536 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ITGB7P26010 798 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ITGB8P26012 769 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CNR2P34972 360 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 IRS1P35568 1242 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SLC9A3P48764 834 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 HSF2Q03933 536 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SPATA19Q7Z5L4 167 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TRAM1L1Q8N609 369 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 FIG4Q92562 907 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PIGKQ92643 395 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 KLK6Q92876 244 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PCED1AQ9H1Q7 454 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 MID1IP1Q9NPA3 183 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CLN6Q9NWW5 311 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TSPAN4O14817 238 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SSNA1O43805 119 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 OTCP00480 354 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 FGF4P08620 206 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 UGT1A6P19224 532 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 UGT1A1P22309 533 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 UGT1A4P22310 534 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 HRH2P25021 359 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CD70P32970 193 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 UGT1A3P35503 534 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 UGT1A5P35504 534 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 AQP4P55087 323 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 MVKQ03426 396 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PFKFB4Q16877 469 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 NDUFAF6Q330K2 333 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PYDC2Q56P42 97 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 C6orf183Q5T699 404 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PAQR3Q6TCH7 311 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SPATA6LQ8N4H0 392 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 RCN3Q96D15 328 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZNF222Q9UK12 451 aa7.44□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 WASH3PC4AMC7 463 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 RGS10O43665 173 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 COX7A2P14406 83 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 AP1S2P56377 157 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TUBB3Q13509 450 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SMU1Q2TAY7 513 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SGO1Q5FBB7 561 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZNF549Q6P9A3 640 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 USP30Q70CQ3 517 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CHSY3Q70JA7 882 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 DPP10Q8N608 796 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SCRN2Q96FV2 425 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 OR2B2Q9GZK3 357 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ENTPD4Q9Y227 616 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 FBP2O00757 339 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZNF195O14628 629 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 AURKAO14965 403 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SBK3P0C264 359 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ERP29P30040 261 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 GPC1P35052 558 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 IFNGR2P38484 337 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 NFATC2Q13469 925 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ZNF77Q15935 545 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 BHLHB9Q6PI77 547 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 MACC1Q6ZN28 852 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 SPAG16Q8N0X2 631 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 OR2M4Q96R27 311 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 NODALQ96S42 347 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 HGH1Q9BTY7 390 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 TBC1D17Q9HA65 648 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ABI3Q9P2A4 366 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 ITM2BQ9Y287 266 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PPIL1Q9Y3C6 166 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 CHD5Q8TDI0 1954 aa7.43□□□□□ -1.22
USP54-210ENST00000466048 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.1 ms