RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460806.1

BHLHE40-202, Transcript of basic helix-loop-helix family member e40, humanhuman

TSL 2

Gene BHLHE40, Length 396 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40-202ENST00000460806 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NKD1Q969G9 470 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NEIL2Q969S2 332 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OR2A5Q96R48 311 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CD244Q9BZW8 370 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PELI2Q9HAT8 420 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TMEM216Q9P0N5 145 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 LGALS13Q9UHV8 139 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.66□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 A0A087WV48 116 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TRBC2A0A5B9 178 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FEZF1A0PJY2 475 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 FITM1A5D6W6 292 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 K7EPI3 171 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CLGNO14967 610 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 P2RX6O15547 441 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZNF749O43361 778 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PRAMEF4O60810 478 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SMIM24O75264 130 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GLRA3O75311 464 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ERLIN1O75477 346 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MED26O95402 600 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 STATHP02808 62 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GSTA1P08263 222 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 HBQ1P09105 142 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KRT4P19013 534 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ITPKBP27987 946 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 RORAP35398 523 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 BCL6P41182 706 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ATP1A2P50993 1020 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 REEP5Q00765 189 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC18A2Q05940 514 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GRM7Q14831 915 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ST3GAL2Q16842 350 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PFKFB4Q16877 469 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PRTGQ2VWP7 1150 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 KRT71Q3SY84 523 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TCTE1Q5JU00 501 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 WASHC2DQ5SRD0 308 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TLDC1Q6P9B6 456 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 NXPE4Q6UWF7 544 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 VN1R4Q7Z5H5 301 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 VASH2Q86V25 355 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TRABD2AQ86V40 505 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 C4orf33Q8N1A6 199 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ESX1Q8N693 406 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 LRFN5Q96NI6 719 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 ZIM3Q96PE6 472 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 DPH1Q9BZG8 443 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 LHX9Q9NQ69 397 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 STARD5Q9NSY2 213 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 WDR70Q9NW82 654 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 OPTCQ9UBM4 332 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 EMCNQ9ULC0 261 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 TMCO1Q9UM00 188 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.65□□□□□ -1.34
BHLHE40-202ENST00000460806 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms