RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457749.6

ZNF28-204, Transcript of zinc finger protein 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF28, Length 4,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28-204ENST00000457749 FANCMQ8IYD8 2048 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CREBBPQ92793 2442 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FEZF1A0PJY2 475 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TRPC5OSA6NMA1 111 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 AIM2O14862 343 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LRATO95237 230 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CKMT1AP12532 417 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CDH1P12830 882 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GLB1P16278 677 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SLC26A3P40879 764 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CCNFP41002 786 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LIMK1P53667 647 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 E2F1Q01094 437 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ART3Q13508 389 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RPE65Q16518 533 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 METRNLQ641Q3 311 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 KRT78Q8N1N4 520 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 OR4F6Q8NGB9 312 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TMEM131Q92545 1883 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 DLG3Q92796 817 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 USP7Q93009 1102 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 VOPP1Q96AW1 172 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FAR2Q96K12 515 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CCDC74BQ96LY2 380 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CD244Q9BZW8 370 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 THSD1Q9NS62 852 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 OCIAD1Q9NX40 245 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CCDC167Q9P0B6 97 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 IKZF3Q9UKT9 509 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 EMCNQ9ULC0 261 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 G3V2L1 256 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TXNDC9O14530 226 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 UBDO15205 165 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 HDAC3O15379 428 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C1orf105O95561 183 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C1QAP02745 245 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C9P02748 559 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GIMD1P0DJR0 217 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 NDUFS1P28331 727 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PNLIPRP1P54315 467 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TBCCQ15814 346 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SPRED3Q2MJR0 410 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 COL28A1Q2UY09 1125 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PGS1Q32NB8 556 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZNF480Q8WV37 535 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PMEPA1Q969W9 287 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 COL26A1Q96A83 441 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 OR6C1Q96RD1 312 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZBTB18Q99592 522 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 MAP3K3Q99759 626 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 AIF1LQ9BQI0 150 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 DPH7Q9BTV6 452 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 STARD5Q9NSY2 213 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 SNX6Q9UNH7 406 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.55□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 A6NL46 340 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 D6RAR5 112 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 NOBOXO60393 691 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 EDF1O60869 148 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ANP32DO95626 131 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PRB1P04280 392 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 CMPK1P30085 196 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 HNMTP50135 292 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 KIAA1024LP59773 190 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 RAB8AP61006 207 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 TBPL1P62380 186 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PHEXP78562 749 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 LRP8Q14114 963 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 PROX2Q3B8N5 592 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 UNC50Q53HI1 259 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ZNF678Q5SXM1 525 aa4.54□□□□□ -1.68
ZNF28-204ENST00000457749 ARMC3Q5W041 872 aa4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms