RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448136.5

SNHG16-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNHG16, Length 3,607 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG16-201ENST00000448136 PRKCDQ05655 676 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SIGLEC14Q08ET2 396 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 KCTD2Q14681 263 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 TATDN3Q17R31 274 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 B3GLCTQ6Y288 498 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SNX20Q7Z614 316 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SCD5Q86SK9 330 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CCDC190Q86UF4 302 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 STAG3L4Q8TBR4 150 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 TRIM63Q969Q1 353 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 LINGO1Q96FE5 620 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CCDC115Q96NT0 180 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 FEVQ99581 238 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ASPNQ9BXN1 380 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 PPT2Q9UMR5 302 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 HMX3A6NHT5 357 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ARNTLO00327 626 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 BTN3A3O00478 584 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ARHGDIAP52565 204 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 FCHO2Q0JRZ9 810 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 HYAL2Q12891 473 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 UGT8Q16880 541 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 DNAJB3Q8WWF6 145 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 MYLPFQ96A32 169 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SEMA3CQ99985 751 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SLA2Q9H6Q3 261 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 HEBP1Q9NRV9 189 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SNX7Q9UNH6 387 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 V9GYH0 126 aa9.75□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 HAS3O00219 553 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 TAPBPO15533 448 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 AP2A2O94973 939 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 APEX1P27695 318 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 TUBA1BP68363 451 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 FADDQ13158 208 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 LRRC32Q14392 662 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SSX1Q16384 188 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 TUBA1AQ71U36 451 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 FAM124AQ86V42 546 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 EFHBQ8N7U6 833 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SYT14Q8NB59 555 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 OR4L1Q8NH43 312 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SIPA1Q96FS4 1042 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 DIRAS2Q96HU8 199 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 EBPLQ9BY08 206 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GREB1Q4ZG55 1949 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 PLD2O14939 933 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SOX6P35712 828 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 BRCC3P46736 316 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 MAN2A2P49641 1150 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 C16orf62Q7Z3J2 963 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GPSM1Q86YR5 675 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GHDCQ8N2G8 530 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 OR4K2Q8NGD2 314 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 POF1BQ8WVV4 589 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 MTERF3Q96E29 417 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 BEX1Q9HBH7 125 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ALG5Q9Y673 324 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 A0A0D9SEW6 157 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 SLC35F4A4IF30 521 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 C19orf81C9J6K1 198 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 IRAK2O43187 625 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ARHGEF9O43307 516 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GSTM1P09488 218 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 AKT1P31749 480 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GPC1P35052 558 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 BTN1A1Q13410 526 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 GRM7Q14831 915 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.74□□□□□ -0.85
SNHG16-201ENST00000448136 B3GNT7Q8NFL0 401 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms