RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SYCE1LA8MT33 242 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 C9J4A7 227 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TAPBPO15533 448 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CDH1P12830 882 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GCAP28676 217 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GMPRP36959 345 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NCF4Q15080 339 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 MUM1Q2TAK8 710 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 C1orf189Q5VU69 101 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KLC3Q6P597 504 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM198BQ6UWH4 519 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 KCTD4Q8WVF5 259 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NEIL2Q969S2 332 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 MVB12AQ96EY5 273 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GPR78Q96P69 363 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 PELI2Q9HAT8 420 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 GPRC5BQ9NZH0 403 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT4Q9NZJ9 180 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 CD274Q9NZQ7 290 aa16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RABGEF1-204ENST00000442563 DSPP15924 2871 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TRBC2A0A5B9 178 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM49D1C9J1S8 452 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVH48-1M5A8F1 160 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 STK16O75716 305 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR47O94967 919 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ALBP02768 609 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 S100BP04271 92 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 GNAZP19086 355 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 IRF9Q00978 393 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC20Q12834 499 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM53BQ14153 422 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR93Q6P2C0 686 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NXPE4Q6UWF7 544 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PLD3Q8IV08 490 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CAMKVQ8NCB2 501 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TTC9Q92623 222 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CABS1Q96KC9 395 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RUFY1Q96T51 708 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS11Q9H270 941 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ACTL8Q9H568 366 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PPCSQ9HAB8 311 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 WWOXQ9NZC7 414 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TCFL5Q9UL49 500 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.08■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MAP2K7O14733 419 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RBP1P09455 135 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MTHFD2P13995 350 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 BCL6P41182 706 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 GDF5P43026 501 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 VSNL1P62760 191 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4F2P78329 520 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NDUFA9Q16795 377 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 OVCH1Q7RTY7 1134 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 VN1R4Q7Z5H5 301 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 FKBP10Q96AY3 582 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 C10orf90Q96M02 699 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 AIF1LQ9BQI0 150 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM79Q9BSE2 394 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CD244Q9BZW8 370 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 NDOR1Q9UHB4 597 aa16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 FEZF1A0PJY2 475 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 KLK8O60259 260 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 RFPL1O75677 317 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 MED26O95402 600 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 ITGAXP20702 1163 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 CXCR2P25025 360 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 AHRP35869 848 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 SCTRP47872 440 aa16.06■□□□□ 0.16
RABGEF1-204ENST00000442563 HSPA7P48741 367 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms