RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441703.5

HDAC6-210, Transcript of histone deacetylase 6, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC6, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6-210ENST00000441703 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TAMM41Q96BW9 452 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 LRRC39Q96DD0 335 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ELMO2Q96JJ3 720 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF778Q96MU6 729 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 COG8Q96MW5 612 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SPON2Q9BUD6 331 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TM6SF2Q9BZW4 377 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NDEL1Q9GZM8 345 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 C20orf27Q9GZN8 174 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 COQ10BQ9H8M1 238 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 MCCC2Q9HCC0 563 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 FGF22Q9HCT0 170 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 LHX9Q9NQ69 397 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ASNSD1Q9NWL6 643 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 COX16Q9P0S2 106 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TAAR2Q9P1P5 351 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 C5AR2Q9P296 337 aa6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.26□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 PRSS38A1L453 326 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 DRGXA6NNA5 263 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NOTOA8MTQ0 251 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TNFRSF10CO14798 259 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 AKAP10O43572 662 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 KLHL41O60662 606 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 BANF1O75531 89 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CLPXO76031 633 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TPPPO94811 219 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM63AO94886 807 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 KRT75O95678 551 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CD160O95971 181 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 BCL10O95999 233 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 KRT1P04264 644 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ERBB2P04626 1255 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ALPPP05187 535 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 RALBP11234 206 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 BMP2P12643 396 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CCNA2P20248 432 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 EPHA3P29320 983 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SLC7A1P30825 629 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 OR1E1P30953 314 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 GKP32189 559 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CDKN2BP42772 138 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SUOXP51687 545 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NME5P56597 212 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 GCNT1Q02742 428 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ELP6Q0PNE2 266 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ATP1A4Q13733 1029 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 DPYSL3Q14195 570 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CYP2A13Q16696 494 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 MTFR2Q6P444 385 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 C4orf22Q6V702 233 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 RPTNQ6XPR3 784 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 BBS12Q6ZW61 710 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 KCNMB4Q86W47 210 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 DSELQ8IZU8 1212 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 DEFB106AQ8N104 65 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CADM3Q8N126 398 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SLC15A4Q8N697 577 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CNTD1Q8N815 330 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 OR7D4Q8NG98 312 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 OR2AP1Q8NGE2 309 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 RASSF5Q8WWW0 418 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 MED30Q96HR3 178 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 OR6C1Q96RD1 312 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 CDRT15Q96T59 188 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 MECRQ9BV79 373 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 GPR87Q9BY21 358 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 RMND5AQ9H871 391 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 NANOGQ9H9S0 305 aa6.25□□□□□ -1.41
HDAC6-210ENST00000441703 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.25□□□□□ -1.41
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