RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OR7A2PQ8NGA2 310 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MENTQ9BUN1 341 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SRRQ9GZT4 340 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1B0GVM2 712 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZAR1LA6NP61 321 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ULK1O75385 1050 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DIRAS1O95057 198 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CST1P01037 141 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR1A1P14550 325 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GRIK1P39086 918 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CASP3P42574 277 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNEQ04844 493 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DGKKQ5KSL6 1271 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EOGTQ5NDL2 527 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PYURFQ96I23 114 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C75A6NL08 312 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PDYNP01213 254 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMG2Q02383 582 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMED1Q13445 227 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT16Q17RD7 645 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 YIF1BQ5BJH7 314 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD3BQ5T9A4 648 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC80Q76M96 950 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PARP16Q8N5Y8 322 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PROX1Q92786 737 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SCRN2Q96FV2 425 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CASD1Q96PB1 797 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PIF1Q9H611 641 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PKD2L2Q9NZM6 624 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND4CQ5VZ89 1909 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC12A8A0AV02 714 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ISPDA4D126 451 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPAN3O60637 253 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RHOBTB1O94844 696 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA1P01009 418 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPIP09923 528 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FMO3P31513 532 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBB2P43320 205 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNG1Q06432 222 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CCSMST1Q4G0I0 132 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC23LQ6PF05 361 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EXT2Q93063 718 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPNS1Q9H2V7 528 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LHX9Q9NQ69 397 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THSD1Q9NS62 852 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF112Q9ULX5 631 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 U3KQV3 271 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM202A6NGA9 273 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HEPACAM2A8MVW5 462 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PI15O43692 258 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TLL1O43897 1013 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRB3O75022 631 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK1P06493 297 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ASGR1P07306 291 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ACADMP11310 421 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC11A1P49279 550 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NR6A1Q15406 480 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NOXRED1Q6NXP6 359 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLECL1Q8IZS7 167 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LIX1Q8N485 282 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND6BQ8NEG7 585 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PDXPQ96GD0 296 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RY13Q9BPV8 354 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MED10Q9BTT4 135 aa3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPV5Q9NQA5 729 aa3.5□□□□□ -1.85
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