RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405546.7

ATG4B-206, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 3,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-206ENST00000405546 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C5orf22Q49AR2 442 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DOK6Q6PKX4 331 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NXPE1Q8N323 547 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 VMP1Q96GC9 406 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 COQ7Q99807 217 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RFXANKO14593 260 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ICMTO60725 284 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MSH3P20585 1137 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 XPAP23025 273 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CRISP3P54108 245 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RPS14P62263 151 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF404Q494X3 552 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM60Q495X7 471 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 BCL7AQ4VC05 210 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR4F3Q6IEY1 312 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DCAF4L2Q8NA75 395 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 HEBP1Q9NRV9 189 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SLC6A13Q9NSD5 602 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CARD8Q9Y2G2 431 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OARD1Q9Y530 152 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GMPPBQ9Y5P6 360 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 VWA8A3KMH1 1905 aa14.57□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SMIM30A4D0T7 59 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 EVPLLA8MZ36 301 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GGT1P19440 569 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DCTP40126 519 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CD83Q01151 205 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FAM217AQ8IXS0 508 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 EID3Q8N140 333 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C10orf111Q8N326 155 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TPD52L3Q96J77 140 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SH3GL1Q99961 368 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NUAK2Q9H093 628 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 MMP28Q9H239 520 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR51E2Q9H255 320 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C3orf18Q9UK00 162 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CENPXA8MT69 81 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CTDSP2O14595 271 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 VIPP01282 170 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LRG1P02750 347 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF366Q8N895 744 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NETO1Q8TDF5 533 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF558Q96NG5 402 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 PANX1Q96RD7 426 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM175Q9BSA9 504 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TULP3O75386 442 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CSF2P04141 144 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR56A5P0C7T3 313 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IGFBP5P24593 272 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 S100A5P33763 92 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GRK5P34947 590 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NSG1P42857 185 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IRF8Q02556 426 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 WDR45BQ5MNZ6 344 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CRTC1Q6UUV9 634 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CEP68Q76N32 757 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 NRARPQ7Z6K4 114 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 UBASH3BQ8TF42 649 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 ZNF639Q9UID6 485 aa14.56□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 H7C0S8 307 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CREG1O75629 220 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SCO1O75880 301 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 IL6P05231 212 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 C7P10643 843 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 CCR7P32248 378 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 Q6ZVU0 165 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SYT12Q8IV01 421 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 SVOPQ8N4V2 548 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 GPR156Q8NFN8 814 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 TP53INP1Q96A56 240 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.55□□□□□ -0.08
ATG4B-206ENST00000405546 KCTD5Q9NXV2 234 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms