RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384622.1

RNU6-540P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 540, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-540P, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-540P-201ENST00000384622 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC38A8A6NNN8 435 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRSS46E5RG02 174 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 K7EQD1 137 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ANKRD28O15084 1053 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZSCAN12O43309 604 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 HBP1O60381 514 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ERLIN1O75477 346 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPP40O75818 363 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 CEACAM4O75871 244 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ADAP00813 363 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 TACSTD2P09758 323 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 DANCRP0C864 163 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CCND1P24385 295 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 AVPR2P30518 371 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 RPS18P62269 152 aaKnown RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 DHODHQ02127 395 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF45Q02386 682 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRKCZQ05513 592 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 REG3AQ06141 175 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 RBL2Q08999 1139 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPP2R5BQ15173 497 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 DECR1Q16698 335 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF674Q2M3X9 581 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 CORO6Q6QEF8 472 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 LINGO2Q7L985 606 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 GID4Q8IVV7 300 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 TTC5Q8N0Z6 440 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 USP38Q8NB14 1042 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 SETD9Q8NE22 299 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 OR1J1Q8NGS3 322 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PIFOQ8TCI5 191 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PPP4R1Q8TF05 950 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 HPS3Q969F9 1004 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 FBXL8Q96CD0 374 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 C8orf37Q96NL8 207 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF416Q9BWM5 594 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 TMEM9Q9P0T7 183 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 KIF17Q9P2E2 1029 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 OGDHLQ9ULD0 1010 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 PRR14LQ5THK1 2151 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 THSD7BQ9C0I4 1608 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF609O15014 1411 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-540P-201ENST00000384622 ZNF407Q9C0G0 2248 aa-1.09□□□□□ -2.58
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RNU6-540P-201ENST00000384622 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 TANC2Q9HCD6 1990 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
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RNU6-540P-201ENST00000384622 RHBDL1O75783 438 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 VTNP04004 478 aa-1.1□□□□□ -2.59
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RNU6-540P-201ENST00000384622 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP-1.1□□□□□ -2.59
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RNU6-540P-201ENST00000384622 C2orf68Q2NKX9 166 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 FBXO43Q4G163 708 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 C5orf47Q569G3 176 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 RAET1LQ5VY80 246 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 JADE1Q6IE81 842 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 EMBQ6PCB8 327 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 C3P1Q6ZMU1 363 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 CYS1Q717R9 158 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 MAEAQ7L5Y9 396 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 NRROSQ86YC3 692 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 CRYBG2Q8N1P7 616 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 C15orf56Q8N910 161 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 SPPL3Q8TCT6 385 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 NAT14Q8WUY8 206 aa-1.1□□□□□ -2.59
RNU6-540P-201ENST00000384622 POF1BQ8WVV4 589 aa-1.1□□□□□ -2.59
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