RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF532Q9HCE3 1301 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ALS2Q96Q42 1657 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1W2PQ67 120 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GOLGA8MH3BSY2 632 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM77I1YAP6 450 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 NDC80O14777 642 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 PFDN6O15212 129 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MAPK13O15264 365 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 SEPT4O43236 478 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 DCTN3O75935 186 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ZWINTO95229 277 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 HOXD13P35453 343 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GSSP48637 474 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 ACTR3P61158 418 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 BTKQ06187 659 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT2Q10471 571 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 NAB2Q15742 525 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 WDR45BQ5MNZ6 344 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CYP4A22Q5TCH4 519 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 RFWD3Q6PCD5 774 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D26Q86UD7 250 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 NOXA1Q86UR1 476 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 FAM133AQ8N9E0 248 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 DDI1Q8WTU0 396 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 GNPTGQ9UJJ9 305 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1257Q9ULG3 409 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 STK38LQ9Y2H1 464 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa3.43□□□□□ -1.86
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PTPRC-202ENST00000367364 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-202ENST00000367364 CTSVO60911 334 aa3.42□□□□□ -1.86
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