RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 HAT1O14929 419 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 ITM2AO43736 263 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 SNNO75324 88 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 OR4F21O95013 312 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 ENO1P06733 434 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 HGFP14210 728 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 NELFEP18615 380 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 CD22P20273 847 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 ARRB2P32121 409 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 TMTC4Q5T4D3 741 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 HOMEZQ8IX15 550 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 SARGQ9BW04 601 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1B0GTL3 188 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CRCPO75575 148 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PDX1P52945 283 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 MED27Q6P2C8 311 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 RGS9BPQ6ZS82 235 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 KIRREL3Q8IZU9 778 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 D2HGDHQ8N465 521 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 RCBTB1Q8NDN9 531 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 REPS1Q96D71 796 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 DEPDC7Q96QD5 511 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SPNS1Q9H2V7 528 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 NT5DC2Q9H857 520 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF10O60809 474 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 MT-CO3P00414 261 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 HES3Q5TGS1 186 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 RNF44Q7L0R7 432 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CDYL2Q8N8U2 506 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SLC29A3Q9BZD2 475 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 STRADBQ9C0K7 418 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 C20orf27Q9GZN8 174 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 RAP2CQ9Y3L5 183 aa26.63■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 FEZF1A0PJY2 475 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 H0YIV9 168 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 NRP2O60462 931 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CTSVO60911 334 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF740Q8NDX6 193 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 TTLQ8NG68 377 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 THAP11Q96EK4 314 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 FAM60AQ9NP50 221 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PILRAQ9UKJ1 303 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CLCA2Q9UQC9 943 aa26.62■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 OR1F1O43749 312 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CAPN1P07384 714 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 HMOX2P30519 316 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO42Q6P3S6 717 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PLD3Q8IV08 490 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 METTL6Q8TCB7 284 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SORT1Q99523 831 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SNX6Q9UNH7 406 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 GSTM2P28161 218 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 OCRLQ01968 901 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ISXQ2M1V0 245 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SH2D4BQ5SQS7 431 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 ATG14Q6ZNE5 492 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 LAS2Q8IYD9 372 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC22Q8N4W6 341 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 AGBL5Q8NDL9 886 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC134Q9H6E4 229 aa26.61■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0J9YVX5 310 aa26.6■■□□□ 1.85
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GIPC1-201ENST00000345425 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 FGF4P08620 206 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 MSL3P1P0C860 447 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 UROSP10746 265 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 AHRP35869 848 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SCTRP47872 440 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CYP4F3Q08477 520 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 MFSD9Q8NBP5 474 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 SEC16BQ96JE7 1060 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 DLL3Q9NYJ7 618 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 HAO1Q9UJM8 370 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PLCL2Q9UPR0 1127 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa26.6■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 CSO75390 466 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
GIPC1-201ENST00000345425 KRT6AP02538 564 aa26.59■■□□□ 1.85
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