RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297598.4

PDP1-201, Transcript of pyruvate dehyrogenase phosphatase catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDP1, Length 4,272 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1-201ENST00000297598 DCST1Q5T197 706 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CORO1BQ9BR76 489 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SLC35A5Q9BS91 424 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CDRT1O95170 752 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 EBLN1P0CF75 366 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 MVKQ03426 396 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TBRG1Q3YBR2 411 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 IER5LQ5T953 404 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CADM3Q8N126 398 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 GTF2H4Q92759 462 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RAB8BQ92930 207 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 IL37Q9NZH6 218 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CFL2Q9Y281 166 aa14.92□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SCAMP1O15126 338 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 PCDH7O60245 1069 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 PREPP48147 710 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SCARB2Q14108 478 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 UGT3A2Q3SY77 523 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SIAEQ9HAT2 523 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 H3BM21 787 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 AQP9O43315 295 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SERPINB7O75635 380 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CKBP12277 381 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TIE1P35590 1138 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 MGLLQ99685 303 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ASPNQ9BXN1 380 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 KCNH6Q9H252 994 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ARNT2Q9HBZ2 717 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SPG21Q9NZD8 308 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CH25HO95992 272 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ANXA8P13928 327 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 NFATC2Q13469 925 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RAB41Q5JT25 222 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ASB18Q6ZVZ8 466 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 FCGR1BQ92637 280 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RRAGCQ9HB90 399 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.91□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 PPIBP23284 216 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SLC5A8Q8N695 610 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RIMKLBQ9ULI2 386 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CORO2BQ9UQ03 480 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TRBC2A0A5B9 178 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 HPRP00739 348 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 LAMP1P11279 417 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 GRB14Q14449 540 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ANGPT1Q15389 498 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 ATG9BQ674R7 924 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TCEANCQ8N8B7 351 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 SOCS4Q8WXH5 440 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 COL21A1Q96P44 957 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 BTN3A3O00478 584 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 CTDSP2O14595 271 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 USP41Q3LFD5 358 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 REPS1Q96D71 796 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 TMCO6Q96DC7 493 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PDP1-201ENST00000297598 MTMR11A4FU01 709 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 E2F3O00716 465 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 KDELR3O43731 214 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 C6orf47O95873 294 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 TUBA1BP68363 451 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 PYCR3Q53H96 274 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 RUNDC3AQ59EK9 446 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.89□□□□□ -0.03
PDP1-201ENST00000297598 LRRC66Q68CR7 880 aa14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms