RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 ZNF69Q9UC07 566 aa16.08■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TPRP12270 2363 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 H3BNX3 289 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 HTR1AP08908 422 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZNF30P17039 623 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ICAM3P32942 547 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CLCQ05315 142 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 EFCAB11Q9BUY7 163 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SQORQ9Y6N5 450 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 FMN2Q9NZ56 1722 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ANKRD46Q86W74 232 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PCED1BQ96HM7 432 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TMEM175Q9BSA9 504 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 USP29Q9HBJ7 922 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 C1orf109Q9NX04 203 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ABRACLQ9P1F3 81 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 KLHL13Q9P2N7 655 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RAB21Q9UL25 225 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SLC16A8O95907 504 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 GPIP06744 558 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CYP3A7P24462 503 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TMEM198Q66K66 360 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 LPGAT1Q92604 370 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SLC15A3Q8IY34 581 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 IL17RCQ8NAC3 791 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SNTG1Q9NSN8 517 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 NUDT15Q9NV35 164 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 EML1O00423 815 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SCAMP1O15126 338 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 HK1P19367 917 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PLEKHG6Q3KR16 790 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 IQCCQ4KMZ1 466 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 NKAPLQ5M9Q1 402 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CATSPEREQ5SY80 951 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 HGSNATQ68CP4 663 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZNF610Q8N9Z0 462 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ARVCFO00192 962 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TGM5O43548 720 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SLC6A4P31645 630 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 LCLAT1Q6UWP7 414 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PDSS2Q86YH6 399 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 MBD5Q9P267 1494 aa16.07■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZMPSTE24O75844 475 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DLG4P78352 724 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 FOXRED2Q8IWF2 684 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DUSP26Q9BV47 211 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 GNG8Q9UK08 70 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 AGLP35573 1532 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 APBB3O95704 486 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CSKP41240 450 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CREB5Q02930 508 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DSC3Q14574 896 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SLC36A3Q495N2 470 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 AADACL4Q5VUY2 407 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TMEM41AQ96HV5 264 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 NODALQ96S42 347 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SFXN1Q9H9B4 322 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 FLRT1Q9NZU1 646 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ACADVLP49748 655 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 SLC2A11Q9BYW1 496 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CNTN3Q9P232 1028 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 GPR34Q9UPC5 381 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 H7C417 338 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 LHCGRP22888 699 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ZYG11AQ6WRX3 759 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 USP43Q70EL4 1123 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TESMINQ9Y4I5 508 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TRMUO75648 421 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CTDNEP1O95476 244 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 S1PR1P21453 382 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 RPP30P78346 268 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 DPYSL2Q16555 572 aa16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
USP13-201ENST00000263966 ROPN1LQ96C74 230 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms