RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258052.7

SMPD2-201, Transcript of sphingomyelin phosphodiesterase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMPD2, Length 1,645 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD2-201ENST00000258052 TMED5Q9Y3A6 229 aa20.38■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.38■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SNX11Q9Y5W9 270 aa20.38■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TMEM131Q92545 1883 aa20.38■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 GSAPA4D1B5 854 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 MAPK1P28482 360 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PIK3CBP42338 1070 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NUDT2P50583 147 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 STX5Q13190 355 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 KIR2DS3Q14952 304 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TMEM26Q6ZUK4 368 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NPAS2Q99743 824 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 DPH7Q9BTV6 452 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 C1orf21Q9H246 121 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NT5DC2Q9H857 520 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SUSD2Q9UGT4 822 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa20.37■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ANKDD1BA6NHY2 528 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 LMO7DNF2Z398 122 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TGFB1P01137 390 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 BCKDHAP12694 445 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 CTSKP43235 329 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 CYP4F2P78329 520 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ACSM2AQ08AH3 577 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 MMEL1Q495T6 779 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ACSM2BQ68CK6 577 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 VN1R5Q7Z5H4 357 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PLD3Q8IV08 490 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PROKR1Q8TCW9 393 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PIGKQ92643 395 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ACTR10Q9NZ32 417 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PILRBQ9UKJ0 227 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 KLHL20Q9Y2M5 609 aa20.36■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 GSC2O15499 205 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 OR1F1O43749 312 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 KRT16P08779 473 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PRPS2P11908 318 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 UGT2B7P16662 529 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 CPOXP36551 454 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 KCNK10P57789 538 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 PTGR1Q14914 329 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ZNF423Q2M1K9 1284 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 DNAL1Q4LDG9 190 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 REP15Q6BDI9 236 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ARL14Q8N4G2 192 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ANKRD53Q8N9V6 530 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 AVL9Q8NBF6 648 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 GPR156Q8NFN8 814 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NELL1Q92832 810 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 OR2A14Q96R47 310 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 EBPLQ9BY08 206 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 RHBGQ9H310 441 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 OR51B5Q9H339 312 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ACTL8Q9H568 366 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 EFCAB1Q9HAE3 211 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 FAM234BA2RU67 622 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 H0YHG0 523 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 FBP2O00757 339 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ANKRD28O15084 1053 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NRP2O60462 931 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 MYO1DO94832 1006 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ITGAXP20702 1163 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 HRH2P25021 359 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 IL12AP29459 219 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 GRK3P35626 688 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 BNC1Q01954 994 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 BIRC2Q13490 618 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ART3Q13508 389 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TRIM73Q86UV7 250 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 CLHC1Q8NHS4 586 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SERPINI1Q99574 410 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 DPY30Q9C005 99 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 SNX7Q9UNH6 387 aa20.35■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa20.34■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 TRBC2A0A5B9 178 aa20.34■□□□□ 0.85
SMPD2-201ENST00000258052 C2orf74A8MZ97 194 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms