RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 ZNF480Q8WV37 535 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CYTH2Q99418 400 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CHST11Q9NPF2 352 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SYBUQ9NX95 663 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.92□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 C8orf89P0DMQ9 161 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MYBL2P10244 700 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 EZRP15311 586 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CLCN7P51798 805 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ABATP80404 500 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MTFR2Q6P444 385 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 C4orf22Q6V702 233 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RPTNQ6XPR3 784 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 NEK10Q6ZWH5 1172 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CENPUQ71F23 418 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PLD3Q8IV08 490 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SLC30A3Q99726 388 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 VN1R1Q9GZP7 353 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 FAM114A2Q9NRY5 505 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PCYOX1Q9UHG3 505 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SOX13Q9UN79 622 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa14.91□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 H0YIG0 161 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 HAT1O14929 419 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CCNDBP1O95273 360 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CATP04040 527 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 BASP1P80723 227 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PMP22Q01453 160 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZNF33BQ06732 778 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 PLAG1Q6DJT9 500 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 XKRXQ6PP77 449 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ASB11Q8WXH4 323 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 ZNF835Q9Y2P0 537 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 MED16Q9Y2X0 877 aa14.9□□□□□ -0.02
NME3-201ENST00000219302 TACC2O95359 2948 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 ZNF839A8K0R7 811 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 A8MUI8 341 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 H7BY64 318 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 GFYI3L273 518 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 PFDN6O15212 129 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 SLC19A2O60779 497 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 UQCRHP07919 91 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 CYC1P08574 325 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 CDK16Q00536 496 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 RBPJQ06330 500 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 C3AR1Q16581 482 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 NDUFA9Q16795 377 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 ZNF766Q5HY98 468 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 ACER2Q5QJU3 275 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 NEPROQ6NW34 567 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 LANCL3Q6ZV70 420 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 GDF7Q7Z4P5 450 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 MDS2Q8NDY4 140 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 METTL21AQ8WXB1 218 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 LURAP1Q96LR2 239 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 TRIM8Q9BZR9 551 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 RBSNQ9H1K0 784 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 TEKT2Q9UIF3 430 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 C2CD3Q4AC94 2353 aa14.89□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 OR2W5A6NFC9 320 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 SMAPO00193 183 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 TPSB2P20231 275 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 AGAP20933 346 aa14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
NME3-201ENST00000219302 AVPR1BP47901 424 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms