RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 FLOT2Q14254 428 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 EOGTQ5NDL2 527 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ACSM2BQ68CK6 577 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR10A6Q8NH74 314 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 MAL2Q969L2 176 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CAMK1GQ96NX5 476 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR52E6Q96RD3 313 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 RHBGQ9H310 441 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC72A6NJI9 287 aa6.33□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 NOXRED1Q6NXP6 359 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PRSS41Q7RTY9 318 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PDZD3Q86UT5 571 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SYT12Q8IV01 421 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR4N5Q8IXE1 308 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 LCN9Q8WX39 176 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 RSC1A1Q92681 617 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 STMN2Q93045 179 aa6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 VEGFDO43915 354 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 AP2A2O94973 939 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ANP32DO95626 131 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR4D2P58180 307 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SQLEQ14534 574 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 COL19A1Q14993 1142 aa6.32□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 ZNF621Q6ZSS3 439 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR2T34Q8NGX1 318 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR2M4Q96R27 311 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CCDC28BQ9BUN5 200 aa6.32□□□□□ -1.4
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CNIH1-201ENST00000216416 C1orf109Q9NX04 203 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 RELNP78509 3460 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 A0A1W2PPV9 198 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CFAP73A6NFT4 308 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 A8MU76 341 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 DIRAS1O95057 198 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PGRP06401 933 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CBSLP0DN79 551 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ACPPP15309 386 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 JUNDP17535 347 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OXTRP30559 389 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CBSP35520 551 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 IST1P53990 364 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 AP1S2P56377 157 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC32Q14392 662 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 NANOGP8Q6NSW7 305 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 KBTBD6Q86V97 674 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR5K2Q8NHB8 316 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 FBXL8Q96CD0 374 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC58Q96CX6 371 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 NANOGQ9H9S0 305 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CAPN10Q9HC96 672 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 VPS29Q9UBQ0 182 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 CROTQ9UKG9 612 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 ICKQ9UPZ9 632 aa6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNIH1-201ENST00000216416 OR6C74A6NCV1 312 aa6.32□□□□□ -1.4
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