RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040783.10

Usp40-201, Transcript of Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Usp40, Length 5,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp40-201ENSMUST00000040783 Rpl10Q6ZWV3 214 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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Usp40-201ENSMUST00000040783 Fam129bQ8R1F1 749 aa7.31□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Mtg1Q8R2R6 326 aa7.31□□□□□ -1.24
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Usp40-201ENSMUST00000040783 Sec24dQ6NXL1 1032 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa7.3□□□□□ -1.24
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Usp40-201ENSMUST00000040783 Cxcr5Q04683 374 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sox4Q06831 440 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 E330014E10RikQ3UL33 481 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Ankrd53Q3V0J4 497 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 D5Ertd577eQ499F0 481 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Gm11992Q5SS90 291 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Sult1c1Q80VR3 304 aa7.3□□□□□ -1.24
Usp40-201ENSMUST00000040783 Fam149aQ8CFV2 787 aa7.3□□□□□ -1.24
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