RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 KIR3DL1P43629 444 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ACVR1Q04771 509 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CDSNQ15517 529 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 BTBD16Q32M84 506 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM205Q6UW68 189 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SUSD1Q6UWL2 747 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 OTUD6BQ8N6M0 293 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR137Q96N19 417 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCD4Q9BRC7 762 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TGIF2Q9GZN2 237 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPA5E9PKD4 350 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF2O75151 1096 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFS3O75489 264 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GRIA1P42261 906 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TLE4Q04727 773 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 GARNL3Q5VVW2 1013 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SPPL2CQ8IUH8 684 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 BEST3Q8N1M1 668 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 IMMP1LQ96LU5 166 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ETNK1Q9HBU6 452 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPA1Q9UND3 350 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MEMO1Q9Y316 297 aa25.92■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 MINDY4Q4G0A6 757 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ADCK2Q7Z695 626 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PAQR7Q86WK9 346 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SMPDL3AQ92484 453 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF354BQ96LW1 612 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCF3Q9NUQ8 709 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD10Q9NXR5 420 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PCYOX1Q9UHG3 505 aa25.91■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXS1O43638 330 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ABOP16442 354 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ST13P50502 369 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TESK1Q15569 626 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTCAP3Q53RY4 240 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ACER2Q5QJU3 275 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35B2Q8TB61 432 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf79Q96F83 325 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 HES7Q9BYE0 225 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 SYNPO2LQ9H987 977 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNK13Q9HB14 408 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TAC3Q9UHF0 121 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.9■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNB1P01574 187 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 PKMP14618 531 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 FDFT1P37268 417 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 AVPR1BP47901 424 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA9Q16795 377 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 LANCL3Q6ZV70 420 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC6Q86X45 466 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 UBL4BQ8N7F7 174 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TC2NQ8N9U0 490 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9A1PQ8NGU1 263 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM136AQ96C01 138 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 VN1R1Q9GZP7 353 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RY12Q9H244 342 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF835Q9Y2P0 537 aa25.89■■□□□ 1.74
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNDC9O14530 226 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SUN1O94901 812 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CCNDBP1O95273 360 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 EFNA3P52797 238 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBA3CQ13748 450 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1C1Q15619 314 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBA3EQ6PEY2 450 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SPNS3Q6ZMD2 512 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG4AQ8WYN0 398 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2A5Q96R48 311 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 AMFRQ9UKV5 643 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 STATHP02808 62 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CD46P15529 392 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PLAG1Q6DJT9 500 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX13Q92968 403 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SPOCK3Q9BQ16 436 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRAC1Q9NRG0 131 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa25.87■■□□□ 1.73
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