RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606884.1

GMDS-AS1-215, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCDC116Q8IYX3 515 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LINC01555Q8NAE3 123 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NAT14Q8WUY8 206 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PIGTQ969N2 578 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LRRC46Q96FV0 321 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 COPS8Q99627 209 aa7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CLCA1A8K7I4 914 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CLDN4O14493 209 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HS6ST1O60243 411 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MAN1A2O60476 641 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SMPD2O60906 423 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 WDR1O75083 606 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PHF2O75151 1096 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HRGP04196 525 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCDC172P0C7W6 258 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MYBL1P10243 752 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GZMAP12544 262 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TACR1P25103 407 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KLK7P49862 253 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AGTR2P50052 363 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ASCL1P50553 236 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 XIAPP98170 497 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NAA25Q14CX7 972 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NFKBIBQ15653 356 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SLC1A5Q15758 541 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GXYLT1Q4G148 440 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SIRPB2Q5JXA9 342 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KAZNQ674X7 775 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RTL6Q6ICC9 239 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PAOXQ6QHF9 649 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PCGF5Q86SE9 256 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PQLC3Q8N755 202 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 MLKLQ8NB16 471 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CCNYQ8ND76 341 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SMPDL3BQ92485 455 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TMEM125Q96AQ2 219 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRIM11Q96F44 468 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GBP4Q96PP9 640 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 VN1R1Q9GZP7 353 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ASB8Q9H765 288 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KCNK13Q9HB14 408 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FAM153AQ9UHL3 310 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 KLHL20Q9Y2M5 609 aa7.15□□□□□ -1.26
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF407Q9C0G0 2248 aa7.15□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 A0A1W2PPR1 153 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRIM64A6NGJ6 449 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TRIM64BA6NI03 449 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 QSOX1O00391 747 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 AP2A2O94973 939 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CD9P21926 228 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ADH7P40394 386 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GRIA3P42263 894 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 CYB561P49447 251 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TAS2R50P59544 299 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 PDK2Q15119 407 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 NOMO1Q15155 1222 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 GPR33Q49SQ1 333 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TEX44Q53QW1 395 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FBXW10Q5XX13 1052 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 FRMPD2BQ6IN97 320 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 SNX20Q7Z614 316 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 HIPK1Q86Z02 1210 aa7.14□□□□□ -1.27
GMDS-AS1-215ENST00000606884 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms