RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596282.5

ZNF548-205, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 5

Gene ZNF548, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-205ENST00000596282 PCDH17O14917 1159 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 ZBTB14O43829 449 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 NRDCO43847 1150 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 BMP10O95393 424 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 SERPINA7P05543 415 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 CCDC175P0C221 793 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PRR35P0CG20 571 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 ICAM2P13598 275 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 EMP3P54852 163 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 ABATP80404 500 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 Q0VFX4 171 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 GPS1Q13098 491 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 INAQ16352 499 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 LONRF1Q17RB8 773 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 HKDC1Q2TB90 917 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PRTGQ2VWP7 1150 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 ABHD17BQ5VST6 288 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 GARNL3Q5VVW2 1013 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 FBXO42Q6P3S6 717 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 SLC34A3Q8N130 599 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PPFIBP2Q8ND30 876 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 C10orf90Q96M02 699 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 BIRC8Q96P09 236 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PKP4Q99569 1192 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 ENAMQ9NRM1 1142 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 PLA2G3Q9NZ20 509 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 MKL2Q9ULH7 1088 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 MYO9AB2RTY4 2548 aa10.59□□□□□ -0.71
ZNF548-205ENST00000596282 ARHGAP10A1A4S6 786 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MAGEB16A2A368 324 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 PRSS44E7EML9 344 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ZG16O60844 167 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MED26O95402 600 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 F10P00742 488 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 CRYABP02511 175 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 C8orf89P0DMQ9 161 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 COX6A1P12074 109 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ADARP55265 1226 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 RBPJQ06330 500 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ZNF33BQ06732 778 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 CUL1Q13616 776 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MINDY4Q4G0A6 757 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 C1QL3Q5VWW1 255 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ATG9BQ674R7 924 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 GFRALQ6UXV0 394 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 LAPTM4BQ86VI4 370 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 PAQR7Q86WK9 346 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 CILP2Q8IUL8 1156 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 REXO1L1PQ8IX06 675 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 PALM2Q8IXS6 379 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 TRIM58Q8NG06 486 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MOCOSQ96EN8 888 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MESP1Q9BRJ9 268 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 IGSF5Q9NSI5 407 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.58□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 A8MUI8 341 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 GOLGA8MH3BSY2 632 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 E2F3O00716 465 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 HAT1O14929 419 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 AVILO75366 819 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 RASAL1O95294 804 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 SLC16A8O95907 504 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 KRT14P02533 472 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 MPC1LP0DKB6 136 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ERGP11308 486 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ARNTP27540 789 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 CXCR5P32302 372 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 TNFSF10P50591 281 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 CASP6P55212 293 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 KCNK10P57789 538 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 GBX1Q14549 363 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 KCNJ11Q14654 390 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 SYT16Q17RD7 645 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 ARMC3Q5W041 872 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 TMEM207Q6UWW9 146 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 NEK10Q6ZWH5 1172 aa10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
ZNF548-205ENST00000596282 CENPUQ71F23 418 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms