RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592578.5

PSME3-215, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 4

Gene PSME3, Length 549 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-215	ENST00000592578	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CDH24	Q86UP0	819 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SMPDL3A	Q92484	453 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	KCNJ9	Q92806	393 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578		A0A0J9YVX5	310 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FITM1	A5D6W6	292 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	AGPS	O00116	658 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MYO1C	O00159	1063 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ERG	P11308	486 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ENO3	P13929	434 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MCM3	P25205	808 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLC1A2	P43004	574 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	RBPJ	Q06330	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	HIF1A	Q16665	826 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OVCH1	Q7RTY7	1134 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	WDR54	Q9H977	334 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MRPS30	Q9NP92	439 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	DHRS7	Q9Y394	339 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	HYKK	A2RU49	373 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CCL21	O00585	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZBTB14	O43829	449 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CCNDBP1	O95273	360 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TTC4	O95801	387 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	UMOD	P07911	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MPC1L	P0DKB6	136 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PGAM1	P18669	254 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PNLIPRP1	P54315	467 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	CUL1	Q13616	776 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PTK6	Q13882	451 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TESK1	Q15569	626 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	RNF44	Q7L0R7	432 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PKP4	Q99569	1192 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLC30A3	Q99726	388 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	DPH7	Q9BTV6	452 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	TRIM8	Q9BZR9	551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MED16	Q9Y2X0	877 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	VPS26A	O75436	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	HAUS5	O94927	633 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SLC16A8	O95907	504 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ERVK-10	P10266	1014 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	ITGAX	P20702	1163 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MMP11	P24347	488 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	OR1D4	P47884	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	SMS	P52788	366 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	NKG7	Q16617	165 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PSME3-215	ENST00000592578	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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