RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf109Q9NX04 203 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 SNX6Q9UNH7 406 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 TMED5Q9Y3A6 229 aa24.65■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 PLXNA2O75051 1894 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa24.64■■□□□ 1.54
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF839A8K0R7 811 aa24.64■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA16Q9BXB7 569 aa24.64■■□□□ 1.54
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CAPNS1-204ENST00000587718 IGHV4-34P06331 123 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SLC2A4P14672 509 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 TIMP2P16035 220 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 CD27P26842 260 aa24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 MAPK1P28482 360 aa24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 A8MX80 341 aa24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 COQ10BQ9H8M1 238 aa24.63■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 KCNH1O95259 989 aa24.62■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF284Q2VY69 593 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA0895LQ68EN5 471 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa24.62■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 SLC13A3Q8WWT9 602 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 DPY30Q9C005 99 aa24.62■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ACTR8Q9H981 624 aa24.62■■□□□ 1.53
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CAPNS1-204ENST00000587718 LIN52Q52LA3 116 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 BTN2A2Q8WVV5 523 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 GLMNQ92990 594 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 CLMPQ9H6B4 373 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 TM7SF3Q9NS93 570 aa24.61■■□□□ 1.53
CAPNS1-204ENST00000587718 DNAJC11Q9NVH1 559 aa24.61■■□□□ 1.53
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