RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 CASC4Q6P4E1 433 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 GAS2L3Q86XJ1 694 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 OR2A5Q96R48 311 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 PKP4Q99569 1192 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 MESP1Q9BRJ9 268 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TGIF2Q9GZN2 237 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 RIC8BQ9NVN3 520 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SYBUQ9NX95 663 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 STMN3Q9NZ72 180 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 GALPQ9UBC7 116 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TAC3Q9UHF0 121 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SOX13Q9UN79 622 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 POLEQ07864 2286 aa7.76□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CTAGE9A4FU28 777 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 E7ENX8 843 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SMAPO00193 183 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 NRP2O60462 931 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 AVILO75366 819 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SLC16A8O95907 504 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SYF2O95926 243 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 STSP08842 583 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ERGP11308 486 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 COX6A1P12074 109 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 HRH2P25021 359 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 AVPR1BP47901 424 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TNFSF10P50591 281 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TERF1P54274 439 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ABATP80404 500 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TAP2Q03519 686 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 FAM53BQ14153 422 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 HKDC1Q2TB90 917 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ICE2Q659A1 982 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 NEK10Q6ZWH5 1172 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CENPUQ71F23 418 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ADCK2Q7Z695 626 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 FJX1Q86VR8 437 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 PAQR7Q86WK9 346 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CILP2Q8IUL8 1156 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 AMER3Q8N944 861 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 MCOLN3Q8TDD5 553 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 METTL21AQ8WXB1 218 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ASB11Q8WXH4 323 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 PSMF1Q92530 271 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 C10orf90Q96M02 699 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SLX1AQ9BQ83 275 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 DRC3Q9H069 523 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 RUBCNLQ9H714 662 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 LZTFL1Q9NQ48 299 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ABCF3Q9NUQ8 709 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 A0A1W2PQ72 361 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 H7BY64 318 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 I3L1I5 382 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 E2F3O00716 465 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 FFAR3O14843 346 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 GPR42O15529 346 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 FOXS1O43638 330 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 ZG16O60844 167 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 KRT14P02533 472 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 MPC1LP0DKB6 136 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 MLNP12872 115 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 SOX11P35716 441 aa7.74□□□□□ -1.17
COCH-211ENST00000557065 CLCN7P51798 805 aa7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms