RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548817.1

TROAP-208, Transcript of trophinin associated protein, humanhuman

TSL 3

Gene TROAP, Length 480 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROAP-208ENST00000548817 NDUFAF7Q7L592 441 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 OTOAQ7RTW8 1153 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 LRRC6Q86X45 466 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ALG3Q92685 438 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CABS1Q96KC9 395 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PANX2Q96RD6 677 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 MIPEPQ99797 713 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ZNF148Q9UQR1 794 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 DUSP10Q9Y6W6 482 aa8.07□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TLN2Q9Y4G6 2542 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 FITM1A5D6W6 292 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PHF2O75151 1096 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 KLHL18O94889 574 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SLCO2B1O94956 709 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RASAL1O95294 804 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SERPINA7P05543 415 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 HEXBP07686 556 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ICAM2P13598 275 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 MST1P26927 711 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 GCGRP47871 477 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 GDF10P55107 478 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ADAM8P78325 824 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 KIF5AQ12840 1032 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CEBPEQ15744 281 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TMEM198Q66K66 360 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 COX15Q7KZN9 410 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 VRK3Q8IV63 474 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 KRT222Q8N1A0 295 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CCDC89Q8N998 374 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CATSPER1Q8NEC5 780 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 HAS2Q92819 552 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PEX13Q92968 403 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 MBD6Q96DN6 1003 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PDLIM2Q96JY6 352 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ETNK1Q9HBU6 452 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 COQ3Q9NZJ6 369 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PTGFRNQ9P2B2 879 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TRPC4Q9UBN4 977 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TEKT2Q9UIF3 430 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TINAGQ9UJW2 476 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TCAF1Q9Y4C2 921 aa8.06□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 HIVEP2P31629 2446 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 GRID2IPA4D2P6 1211 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RCCD1A6NED2 376 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ZNF839A8K0R7 811 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 IQCF5A8MTL0 148 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 E9PLN8 166 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 AP3B1O00203 1094 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TXNDC9O14530 226 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PRAMEF2O60811 474 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CTSVO60911 334 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SUN1O94901 812 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ZWINTO95229 277 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 CCNDBP1O95273 360 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 BMP10O95393 424 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 C1orf105O95561 183 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 APRTP07741 180 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 INHBBP09529 407 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PRR35P0CG20 571 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PKMP14618 531 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 DNASE1P24855 282 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 GRB7Q14451 532 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 PCID2Q5JVF3 399 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 ZNF534Q76KX8 674 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 TMEM151BQ8IW70 566 aa8.05□□□□□ -1.12
TROAP-208ENST00000548817 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms