RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538037.5

PUS1-207, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene PUS1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-207ENST00000538037 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PANX3Q96QZ0 392 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 YIPF2Q9BWQ6 316 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 AMFRQ9UKV5 643 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 I3L1I5 382 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 KPNA5O15131 536 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 P2RX6O15547 441 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 LIASO43766 372 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 GAS8O95995 478 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 GARNL3Q5VVW2 1013 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MTFR2Q6P444 385 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ACRBPQ8NEB7 543 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 OR9A1PQ8NGU1 263 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 TSPY26PQ9H489 355 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 GNPTGQ9UJJ9 305 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ARHGEF33A8MVX0 844 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 SLC19A2O60779 497 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ERVK-10P10266 1014 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ICAM2P13598 275 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 AGAP20933 346 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 NMBRP28336 390 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 CRADDP78560 199 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PCID2Q5JVF3 399 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ABHD17BQ5VST6 288 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PEX26Q7Z412 305 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 LRRC6Q86X45 466 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 RAB42Q8N4Z0 105 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 SMPDL3AQ92484 453 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PANX2Q96RD6 677 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 NPAS2Q99743 824 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 RAB6BQ9NRW1 208 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 TINAGQ9UJW2 476 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MKL2Q9ULH7 1088 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.48■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 CACNA1CQ13936 2221 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MYO1CO00159 1063 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP20.47■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 26.8
PUS1-207ENST00000538037 FTCDO95954 541 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 RELAQ04206 551 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MDS2Q8NDY4 140 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 HES6Q96HZ4 224 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 CYTH2Q99418 400 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 VN1R1Q9GZP7 353 aa20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 OR2W5A6NFC9 320 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PHF2O75151 1096 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 NIPSNAP2O75323 286 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 NDUFS3O75489 264 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 IFNB1P01574 187 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ZNF33BQ06732 778 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 GTF3C1Q12789 2109 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 FAM53BQ14153 422 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ZNF766Q5HY98 468 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ICE2Q659A1 982 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 FCRLBQ6BAA4 426 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MPP5Q8N3R9 675 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 UBL4BQ8N7F7 174 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ACBD4Q8NC06 268 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 GSDMBQ8TAX9 411 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 LPGAT1Q92604 370 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PKP4Q99569 1192 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 HES7Q9BYE0 225 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.46■□□□□ 0.87
PUS1-207ENST00000538037 ZFHX3Q15911 3703 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 A8MUI8 341 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 MAN1A2O60476 641 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 APRTP07741 180 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 ATP5DP30049 168 aa20.45■□□□□ 0.86
PUS1-207ENST00000538037 FMO4P31512 558 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms