RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	PRRG2	O14669	202 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	P2RX6	O15547	441 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	GYPC	P04921	128 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MYBL2	P10244	700 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FOSL1	P15407	271 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	RFC3	P40938	356 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	BDKRB1	P46663	353 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FOLH1	Q04609	750 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ITIH4	Q14624	930 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	POU6F1	Q14863	301 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SLC18A3	Q16572	532 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	DCUN1D3	Q8IWE4	304 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KRT222	Q8N1A0	295 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	NINJ1	Q92982	152 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ARSG	Q96EG1	525 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	DPH7	Q9BTV6	452 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		11.45	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MROH6	A6NGR9	719 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	GABRR3	A8MPY1	467 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	HACD1	B0YJ81	288 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557		H7C0C1	242 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf105	O95561	183 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	STATH	P02808	62 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CD46	P15529	392 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PTGS2	P35354	604 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ATP5O	P48047	213 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	EMP3	P54852	163 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CES4A	Q5XG92	561 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OR2A5	Q96R48	311 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ACAT2	Q9BWD1	397 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.44	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KLK8	O60259	260 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZWINT	O95229	277 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TPO	P07202	933 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OR56A5	P0C7T3	313 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF24	P17028	368 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	AOAH	P28039	575 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CHRNB4	P30926	498 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	NUP107	P57740	925 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PMPCA	Q10713	525 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MYBPH	Q13203	477 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	IQCB1	Q15051	598 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MEP1A	Q16819	746 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	BBS12	Q6ZW61	710 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF534	Q76KX8	674 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	PAQR7	Q86WK9	346 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	KIF2B	Q8N4N8	673 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	STYX	Q8WUJ0	223 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ASB5	Q8WWX0	329 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	MVB12A	Q96EY5	273 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF778	Q96MU6	729 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	GPATCH1	Q9BRR8	931 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	DNAJC13	O75165	2243 aa		11.43	□□□□□ -0.58
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		11.42	□□□□□ -0.58

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