RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNA2P51530 1060 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFP69Q49AA0 526 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 HECTD3Q5T447 861 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 GLRX5Q86SX6 157 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 KLHDC1Q8N7A1 406 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR7A2PQ8NGA2 310 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 METTL21AQ8WXB1 218 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 PYCR2Q96C36 320 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC3Q9BQI4 270 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF186Q9NXI6 227 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 ERAP1Q9NZ08 941 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-334P-201ENST00000517072 F8VVB4 439 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 F8VWA3 439 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PSMA7O14818 248 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 TEX28O15482 410 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKCIP41743 596 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SP3Q02447 781 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SGCGQ13326 291 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRIM29Q14134 588 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZNF74Q16587 644 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPR33Q49SQ1 333 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SUSD4Q5VX71 490 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARMC3Q5W041 872 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 Q6ZSR9 355 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 RCOR2Q8IZ40 523 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM89BQ8N5H3 189 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GATAD1Q8WUU5 269 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PIK3R3Q92569 461 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 AK8Q96MA6 479 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 INTS14Q96SY0 518 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 C5orf52A6NGY3 159 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 C17orf105B2RV13 164 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM86B1E9PN63 330 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FCGR3BO75015 233 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 BAG3O95817 575 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATP1B1P05026 303 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SERPING1P05155 500 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 STAG3L1P0CL83 205 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRKAR1AP10644 381 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SFTPDP35247 375 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GUCY2DQ02846 1103 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 CEP85LQ5SZL2 805 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 BHLHB9Q6PI77 547 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 LEKR1Q6ZMV7 388 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FCRLAQ7L513 359 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 OR8H3Q8N146 312 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCLK2Q8N568 766 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 CCDC63Q8NA47 563 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 BTBD9Q96Q07 612 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRT12Q99456 494 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDK19Q9BWU1 502 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF121Q9H920 327 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A087X002 238 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FLRT2O43155 660 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPIP5K2O43314 1243 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 SOAT1P35610 550 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PAX9P55771 341 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP10-9P60411 292 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 PTK6Q13882 451 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 EXT1Q16394 746 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 TAZQ16635 292 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 FUT10Q6P4F1 479 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 C11orf88Q6PI97 169 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 BTN2A1Q7KYR7 527 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 GPR141Q7Z602 305 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-334P-201ENST00000517072 HOGA1Q86XE5 327 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms