RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN14	O95500	239 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GSTM1	P09488	218 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FDXR	P22570	491 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MCM3	P25205	808 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIA3	P42263	894 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-9	P60411	292 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBED6	P86452	979 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	KLC1	Q07866	573 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPSAP1	Q14558	356 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR33	Q49SQ1	333 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TCTE1	Q5JU00	501 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD7	Q6UXD7	560 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	COX15	Q7KZN9	410 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	HAS2	Q92819	552 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC45	Q96CN5	670 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP14	A8MT82	685 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	QSOX1	O00391	747 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SPOP	O43791	374 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AP2A1	O95782	977 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MLYCD	O95822	493 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FTH1	P02794	183 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SERPINA7	P05543	415 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR35	P0CG20	571 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CD1E	P15812	388 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ACRV1	P26436	265 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MST1	P26927	711 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN7	P51798	805 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1I3	Q14994	352 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TESK1	Q15569	626 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SF1	Q15637	639 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	C3AR1	Q16581	482 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LONRF1	Q17RB8	773 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC181	Q5TID7	509 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC38	Q5VT99	294 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF304	Q9HCX3	659 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NF1	P21359	2839 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C0C1	242 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF2	O60811	474 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AP2A2	O94973	939 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	BMP10	O95393	424 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	WDPCP	O95876	746 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM253	P0C7T8	217 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVK-10	P10266	1014 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AGA	P20933	346 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5O	P48047	213 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	EMP2	P54851	167 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AP2B1	P63010	937 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TPM4	P67936	248 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PMP22	Q01453	160 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	OLIG2	Q13516	323 aa		10.31	□□□□□ -0.76

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