RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491592.1

RTN4-215, Transcript of reticulon 4, human

TSL 2

Gene RTN4, Length 860 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RTN4-215	ENST00000491592	LCP2	Q13094	533 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	IL18	Q14116	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	LPIN1	Q14693	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GRM4	Q14833	912 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SLC18A3	Q16572	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ACCSL	Q4AC99	568 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NADK2	Q4G0N4	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TIGD4	Q8IY51	512 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	AGAP11	Q8TF27	550 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	RASD2	Q96D21	266 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SECISBP2	Q96T21	854 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC28B	Q9BUN5	200 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	VCX	Q9H320	206 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PADI1	Q9ULC6	663 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TFR2	Q9UP52	801 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DOCK2	Q92608	1830 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	RREB1	Q92766	1687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	LRRC53	A6NM62	1247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	TEX22	C9J3V5	150 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SNX3	O60493	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CTAG2	O75638	210 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GSTA2	P09210	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PRPS2	P11908	318 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	POU2F1	P14859	743 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CTPS1	P17812	591 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CPN2	P22792	545 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PCGF2	P35227	344 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CPOX	P36551	454 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CETN2	P41208	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SLC1A4	P43007	532 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PTH2R	P49190	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	ARSE	P51690	589 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DGKQ	P52824	942 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PNLIPRP2	P54317	469 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	MFAP3	P55082	362 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SST	P61278	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	NCALD	P61601	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	DMPK	Q09013	629 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	OLIG2	Q13516	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GRAP	Q13588	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	GNA13	Q14344	377 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CSHL1	Q14406	222 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	PDIA5	Q14554	519 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CEBPE	Q15744	281 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	IL17A	Q16552	155 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	P3H1	Q32P28	736 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CCDC14	Q49A88	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CASC4	Q6P4E1	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
RTN4-215	ENST00000491592	CES3	Q6UWW8	571 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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