RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-208ENST00000487290 CLN3Q13286 438 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TLDC1Q6P9B6 456 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SLC5A11Q8WWX8 675 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NEIL2Q969S2 332 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 WWOXQ9NZC7 414 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CD274Q9NZQ7 290 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TBK1Q9UHD2 729 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PLAAQ9Y263 795 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SLC22A14Q9Y267 594 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 KCNE2Q9Y6J6 123 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa15.87■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 E7EQ34 232 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TK2O00142 265 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 STX16O14662 325 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TERTO14746 1132 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 HAT1O14929 419 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SCRG1O75711 98 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 MT-ND3P03897 115 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CDH1P12830 882 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF28P17035 718 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 EPORP19235 508 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CASP2P42575 452 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SLCO1A2P46721 670 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 GLRBP48167 497 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 REEP5Q00765 189 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ZNF844Q08AG5 666 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CDC16Q13042 620 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PRTGQ2VWP7 1150 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 DEFB110Q30KQ9 67 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TRABD2AQ86V40 505 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SELENOSQ9BQE4 189 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CAPS2Q9BXY5 557 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ULBP3Q9BZM4 244 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CD244Q9BZW8 370 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 DNAJC11Q9NVH1 559 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SRPK3Q9UPE1 567 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ASB1Q9Y576 335 aa15.86■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 A0A1W2PPM1 405 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SUPT3HB4E1H0 165 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 H7BY64 318 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 AGRPO00253 132 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 GLRA3O75311 464 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SUPT3HO75486 399 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 OR2B3O76000 313 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 KIAA0754O94854 1291 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 WDR47O94967 919 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ONECUT2O95948 504 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 HBQ1P09105 142 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PYGBP11216 843 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 GNAZP19086 355 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 CCR8P51685 355 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ABHD18Q0P651 414 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TBCCQ15814 346 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ATG9BQ674R7 924 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 FRMPD2BQ6IN97 320 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 GPR135Q8IZ08 494 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NLGN4XQ8N0W4 816 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 ESX1Q8N693 406 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PROKR1Q8TCW9 393 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 NKD1Q969G9 470 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TSNARE1Q96NA8 513 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 DCDC2Q9UHG0 476 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 LOC400499M0QZD8 3231 aa15.85■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 TRBC2A0A5B9 178 aa15.84■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 K7EPI3 171 aa15.84■□□□□ 0.13
HCLS1-208ENST00000487290 RAD1O60671 282 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms