RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR5AR1Q8NGP9 310 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR6Y1Q8NGX8 325 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FBXO30Q8TB52 745 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RHBDF1Q96CC6 855 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR52B2Q96RD2 323 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A17Q9H1V8 727 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SMOXQ9NWM0 555 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CER1O95813 267 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GSNP06396 782 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 F3P13726 295 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MAOBP27338 520 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 IFNGR2P38484 337 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RAB8AP61006 207 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 DPTQ07507 201 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM31Q5JXX7 168 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM198Q66K66 360 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 P3H2Q8IVL5 708 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PTERQ96BW5 349 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KCNA7Q96RP8 456 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM184CQ9NVA4 438 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PCTPQ9UKL6 214 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SARDHQ9UL12 918 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PRB8 838 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FZD6O60353 706 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 UBXN7O94888 489 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 PROS1P07225 676 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 HSPB3Q12988 150 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa8.01□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 DNAJC9Q8WXX5 260 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LRMDAQ9H2I8 198 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MUC13Q9H3R2 512 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 EQTNQ9NQ60 294 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR6C2Q9NZP2 312 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 COPS7AQ9UBW8 275 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TET1Q8NFU7 2136 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 OR52A4PA6NMU1 304 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MOSPD3O75425 235 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 JAK1P23458 1154 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ACSL1P33121 698 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GCKP35557 465 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF33BQ06732 778 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 XAGE5Q8WWM1 108 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ASB11Q8WXH4 323 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LRCH3Q96II8 777 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TGM7Q96PF1 710 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 REEP1Q9H902 201 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGEF33A8MVX0 844 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C9JVG2 144 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF10CO14798 259 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 UGDHO60701 494 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM11AP58511 58 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 TMEM26Q6ZUK4 368 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FBXW8Q8N3Y1 598 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf65Q8NCR3 313 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ALG14Q96F25 216 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ADNPQ9H2P0 1102 aa8□□□□□ -1.13
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PTPRD-211ENST00000486161 AP4S1Q9Y587 144 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 G3V2L1 256 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 AK4P27144 223 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 CCR5P51681 352 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1024LP59773 190 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF763Q0D2J5 394 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 LEXMQ3ZCV2 418 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 FGD3Q5JSP0 725 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 GCNT6Q5T4J0 391 aa8□□□□□ -1.13
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD46Q86W74 232 aa8□□□□□ -1.13
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